Determining Photoreceptor Cell Identity: Rod Versus Cone Fate Governed by <i>tbx2b</i> Opposing <i>nrl</i>
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: NRL is an influential transcription factor and central to animal modeling in ophthalmology. Disrupting NRL abrogates rod development and produces an excess of S-cones (also known as "UV cones" or "short-wavelength-sensitive1 [SWS1] cones"). Strikingly, mutations in zebrafish tbx2b produce the exact opposite phenotypes (excess rods and loss of SWS1 cones). We sought to define what genetic relationship exists, if any, between these transcription factors. We also infer whether these two phenotypes (altered rod abundance and altered SWS1 cone abundance) are independent versus inter-related. Methods: Zebrafish mutants were bred to disrupt nrl and tbx2b in concert. Rods and SWS1 cones were quantified and characterized at ultrastructural and transcriptional levels. Results: Considering single mutant zebrafish, we confirmed previously established phenotypes and noted that the number of rods lost in nrl-/- mutants is reflected by a concomitant increase in SWS1 cone abundance. The tbx2b-/- mutants present the opposite phenotype(s) but exhibit a similar trade-off in cell abundances, with lots of rods and a concomitant decrease in SWS1 cones. Double mutant nrl-/-;tbx2b-/- zebrafish recapitulate the nrl-/- mutant phenotype(s). Conclusions: The tbx2b is thought to be required for producing SWS1 cones in zebrafish, but this can be over-ridden when nrl is absent. Regarding the altered cell abundances observed in either tbx2b-/- or nrl-/- mutants, the alterations in rod and SWS1 cones appear to not be two separate phenotypes but are instead a single intertwined outcome. The tbx2b and nrl are in an epistatic relationship, with nrl phenotypes dominating, implying that tbx2b is upstream of nrl in photoreceptor cell fate determination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».