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Enregistrement W4391147818 · doi:10.1016/j.jim.2024.113619

Immunofluorescence analysis of human eosinophils

2024· article· en· W4391147818 sur OpenAlexafffund
Sarah Almas, Nawell Fayad, Ojas Srivastava, Mujtaba Siddique, Sharanya Das, Nicolas Touret, Xuejun Sun, Paige Lacy

Notice bibliographique

RevueJournal of Immunological Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOffice of the Provost, University of South CarolinaLung Association, Alberta and NWT
Mots-clésImmunofluorescenceBiologyAntibodyEosinophilParaformaldehydeMolecular biologyImmunologyCell biologyPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A prominent inflammatory cell type in allergic diseases is the eosinophil, a granulated white blood cell that releases pro-inflammatory cytokines. Eosinophil-derived cytokines, including interleukin-9 (IL-9) and interleukin-13 (IL-13), can skew the immune response towards an allergic phenotype. Unfortunately, it is challenging to immunolabel and collect quantifiable images of eosinophils given their innate autofluorescence and ability to nonspecifically bind to antibodies. Hence, it is important to optimize permeabilization, blocking, and imaging conditions for eosinophils. Here, we show enhanced protocols to ensure that measured immunofluorescence represents specific immunolabelling. To test this, eosinophils were purified from human blood, adhered to glass coverslips, stimulated with or without platelet-activating factor (PAF), fixed with paraformaldehyde, and then permeabilized with Triton X-100 or saponin. Cells were then blocked with goat serum or human serum and incubated with antibodies labelling cytokines (IL-9 and IL-13) and secretory organelles (CD63 for crystalloid granules and transferrin receptor [TfnRc] for recycling endosomes). Carefully selected isotype controls were used throughout, and cells were imaged using Deltavision super-resolution microscopy. Intensities of fluorescent probes were quantified using Volocity software. Our findings show that permeabilization with saponin, blockage with human serum, and using concentrations of antibodies up to 10 μg/ml allowed us to detect marked differences in fluorescence intensities between isotypes and test antibodies. With the achievement of sufficient qualitative and quantitative measures of increased test probe intensity compared to respective isotypes, these results indicate that our protocol allows for optimal immunolabelling of eosinophils. Using this protocol, future studies may provide further insights into trafficking mechanisms within this important inflammatory cell type.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,834
Score d'incertitude au seuil0,655

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,399 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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