P225 Mucosal transcriptomic profiles associated with clinical response in patients with Ulcerative Colitis receiving filgotinib
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Filgotinib (FIL) is an oral, once-daily, JAK1 preferential inhibitor approved for the treatment of Ulcerative Colitis (UC). In the phase 2b/3 SELECTION trial (NCT02914522), FIL had a high level of efficacy in inducing and maintaining histological remission and endoscopic response, relative to placebo (PBO). Here, we described the changes in the mucosal transcriptomic profiles associated with histologic and endoscopic responses following FIL or PBO treatment. Methods Patients with moderately to severely active UC were enrolled into one of two cohorts (biologic-naive or biologic-experienced) and randomized 2:2:1 to receive FIL 200 mg (FIL200), FIL 100 mg (FIL100) or PBO from baseline to week 10. RNA was extracted from colon biopsies collected at baseline and week 10, and RNA sequencing (RNA-seq) was performed according to standard protocols. Clinical responses of interest included histological remission (assessed by categorical Geboes score) and endoscopic response (both defined in Figure legend) at week 10. To assess transcriptional variability, RNA-Seq data were analyzed by a spectral map separately for baseline and week 10. Differentially expressed gene (DEG) analysis was used to explore differences in transcriptional expression for multiple comparators: from baseline to week 10 between patients with or without clinical response, separately, by treatment arm and cohort. Results RNA-Seq data were available for 1086 patients across treatment arms at baseline and/or week 10. Spectral map analysis showed no visual association between baseline transcriptional variability (principal component [PC]1: 26%) and achieving either histological remission or endoscopic response at week 10, nor with the treatment arm. At week 10, the main source of transcriptional variability (PC1: 32%) was visually associated with achieving histological remission or endoscopic response, but not with the treatment arm. From the DEG analysis, more significant genes were associated with histological remission in the FIL200 arm compared with either the FIL100 or PBO arms, especially for biologic-naive compared with biologic-experienced patients (Figure A). Furthermore, more significant genes were associated with endoscopic response in the FIL arms compared with PBO (Figure B). Conclusion The overall transcriptional response associated with histological remission or endoscopic response was greater in FIL treatment arms than the PBO arm. This transcriptional response differed between biologic-naive and experienced patients, suggesting that transcriptional changes associated with clinical response were influenced by both FIL treatment and previous biologic use. Preliminary data suggests these transcriptional changes occur in pathways related to UC pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».