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Enregistrement W4391162952 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjad212.0374

P244 The first step to IBD prevention exploring rate of pre-clinical inflammation in subset of asymptomatic subjects at risk of IBD: screening stage of the PIONIR trial

2024· article· en· W4391162952 sur OpenAlexaffabout
S Kenigsberg, Williams Turpin, S H Lee, Oren Ledder, Y Shimhlash, Anne M. Griffiths, H Huynh, Anthony Otley, Irit Avni‐Biron, Kevan Jacobson, Remo Panaccione, Alain Bitton, Ken Croitoru, Dan Turner

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of CalgaryBC Children's HospitalUniversity of WinnipegStollery Children's HospitalHospital for Sick ChildrenIzaak Walton Killam Health CentreUniversity of ManitobaMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAsymptomaticMedicineStage (stratigraphy)Internal medicineInflammationGastroenterologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background With the increasing prevalence of inflammatory bowel diseases (IBD) globally, it is necessary to start focusing efforts on prevention of the diseases. The Genetic, Environmental, Microbial (GEM) study identified biological signatures predictive of developing IBD in first degree relatives (FDR) of patients with Crohn’s disease (CD). The ongoing PIONIR (Preventing IBD ONset in Individuals at Risk) study is a randomized controlled trial aimed to explore whether the Tasty & Healthy diet can change the CD-risk associated biomarkers of healthy FDRs who are particularly high risk of developing CD, originally followed in the GEM cohort. We report here the rate of IBD and pre-IBD inflammation in a subset cohort. Methods Subjects, 6-35 years of age from the GEM cohort who were identified by a combination of predictors at recruitment to GEM to have an increased risk for persistently elevated fecal calprotectin (FC) (i.e. Microbiome Risk Score (MRS), increased gut permeability and/or multiplex family of CD) were approached to perform a new FC test. Subjects who had FC>70µg/g, confirmed by a second sample, were offered a panenteric video capsule endoscopy (VCE), but some elected to proceed to ileocolonoscopy instead. Results For the PIONIR recruitment, a total of 450 subjects were approached from 7 sites in Israel and Canada, of whom 183 consented and provided a stool sample for FC (Figure). FC was elevated in 57 (31%) subjects, confirmed by re-testing in 36 (20%); 25/36 underwent VCE/ileocolonoscopy (Figure). In total, 8 (4.4% of the screened cohort) had normal-appearing mucosa, in 10 (5.5%) there were non-specific mucosal changes (e.g. several erosions or erythema), 6 (3.3%) had ulcers compatible with CD and 1 (0.6%) was inconclusive. The median FC of those eventually diagnosed with CD (816 [IQR 361-1123) was higher than the remaining 30 without IBD with elevated FC (175 [111-281], p=0.003). FC>275µg/g was highly predictive of CD in the entire cohort (AUROC 0.97 (95%CI 0.93-0.99); sensitivity 83%, specificity 94%). Conclusion Preclinical mucosal inflammation in VCE/ileocolonoscopy was found in 18 of 183 (9.8%) screened subjects (i.e. elevated FC with either normal or nonspecific mucosal findings), 134 (73%) had normal FC and 11 (6%) with elevated FC had missing VCE/ileocolonoscopy data. Six had CD (3.3%, or 17% of the 36 with elevated FC). Detecting subjects at risk at their preclinical stages, possibly with FC>275µg/g, is the first necessary step in developing preventive strategies for IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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