MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4391170745 · doi:10.1021/acs.est.3c05643

Chemical Space Covered by Applicability Domains of Quantitative Structure–Property Relationships and Semiempirical Relationships in Chemical Assessments

2024· article· en· W4391170745 sur OpenAlexaff
Zhizhen Zhang, Alessandro Sangion, Shenghong Wang, Todd Gouin, Trevor N. Brown, Jon A. Arnot, Li Li

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of TorontoThe Scarborough HospitalARC Resources (Canada)
Organismes subventionnairesEuropean Chemical Industry Council
Mots-clésBiochemical engineeringBioaccumulationChemical spaceQuantitative structure–activity relationshipReactivity (psychology)Molecular descriptorChemistryEnvironmental chemistryStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A significant number of chemicals registered in national and regional chemical inventories require assessments of their potential "hazard" concerns posed to humans and ecological receptors. This warrants knowledge of their partitioning and reactivity properties, which are often predicted by quantitative structure-property relationships (QSPRs) and other semiempirical relationships. It is imperative to evaluate the applicability domain (AD) of these tools to ensure their suitability for assessment purpose. Here, we investigate the extent to which the ADs of commonly used QSPRs and semiempirical relationships cover seven partitioning and reactivity properties of a chemical "space" comprising 81,000+ organic chemicals registered in regulatory and academic chemical inventories. Our findings show that around or more than half of the chemicals studied are covered by at least one of the commonly used QSPRs. The investigated QSPRs demonstrate adequate AD coverage for organochlorides and organobromines but limited AD coverage for chemicals containing fluorine and phosphorus. These QSPRs exhibit limited AD coverage for atmospheric reactivity, biodegradation, and octanol-air partitioning, particularly for ionizable organic chemicals compared to nonionizable ones, challenging assessments of environmental persistence, bioaccumulation capability, and long-range transport potential. We also find that a predictive tool's AD coverage of chemicals depends on how the AD is defined, for example, by the distance of a predicted chemical from the centroid of the training chemicals or by the presence or absence of structural features.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEnvironmental Science & TechnologyMême sujetComputational Drug Discovery MethodsTravaux en français237 207