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Enregistrement W4391179203 · doi:10.1016/j.cbpb.2024.110947

Mitochondrial techniques for physiologists

2024· article· en· W4391179203 sur OpenAlexafffund
Soren Z. Coulson, Brynne M. Duffy, James F. Staples

Notice bibliographique

RevueComparative Biochemistry and Physiology Part B Biochemistry and Molecular Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMitochondrionBiologyRespirometryReactive oxygen speciesFunction (biology)Cell biologyAdenosine triphosphateBioenergeticsMitochondrial DNAComputational biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondria serve several important roles in maintaining cellular homeostasis, including adenosine triphosphate (ATP) synthesis, apoptotic signalling, and regulation of both reactive oxygen species (ROS) and calcium. Therefore, mitochondrial studies may reveal insights into metabolism at higher levels of physiological organization. The apparent complexity of mitochondrial function may be daunting to researchers new to mitochondrial physiology. This review is aimed, therefore, at such researchers to provide a brief, yet approachable overview of common techniques used to assess mitochondrial function. Here we discuss the use of high-resolution respirometry in mitochondrial experiments and common analytical platforms used for this technique. Next, we compare the use of common mitochondrial preparation techniques, including adherent cells, tissue homogenate, permeabilized fibers and isolated mitochondria. Finally, we outline additional techniques that can be used in tandem with high-resolution respirometry to assess additional aspects of mitochondrial metabolism, including ATP synthesis, calcium uptake, membrane potential and reactive oxygen species emission. We also include limitations to each of these techniques and outline recommendations for experimental design and interpretation. With a general understanding of methodologies commonly used to study mitochondrial physiology, experimenters may begin contributing to our understanding of this organelle, and how it affects other physiological phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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