Gelatinous matrix, an original strategy to cope with oligotrophy in Nassellaria (Radiolaria)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Radiolaria are heterotrophic protists abundant in the world’s oceans playing important roles in biogeochemical cycles. Some species host photosynthetic algae also contributing to primary production. Such mixotrophic behaviour is believed to explain their ecological success in oligotrophic waters, notably Collodaria, exclusively mixotrophic radiolarians within a gelatinous matrix. Yet, our understanding of Radiolaria ecology is limited to direct observations, as they have so far withstood reproduction in culture and their genomes are unexplored. Sampling oligotrophic California Current communities revealed an abundant, rarely observed population of Nassellaria of the genus Phlebarachnium , characterized to live within a gelatinous matrix along with other Radiolaria. Phylogenetic reconstruction of the ribosomal DNA suggests that these distantly related lineages within Nassellaria independently developed the ability to produce a gelatinous matrix ∼150 million years ago. By matching physical samples with their genetic signature, we identified these rarely observed organisms in global metabarcoding datasets, revealing strong biogeographic affinity to oligotrophic water masses. Global ocean co-occurrence networks showed that Radiolaria with a gelatinous matrix have a distinct biogeography compared to those without the matrix. Results suggest that the gelatinous matrix is an adaptation to oligotrophic waters, but further research is needed to evaluate similarities between the gelatinous matrices across different Radiolaria groups. This strategy could increase the effective volume to weight ratio favoring prey capture and create a favorable microenvironment for symbionts, enhancing ecological success in nutrient-depleted waters. This study advances our understanding of eukaryotic diversity evolution, emphasizing specific advantages of certain adaptations, specifically when evolution occurs independently across lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».