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Enregistrement W4391228458 · doi:10.1094/pdis-10-23-2044-pdn

Occurrence of Leaf Spot on <i>Elaeocarpus decipiens</i> Caused by <i>Alternaria alternata</i>, a New Disease in China

2024· article· en· W4391228458 sur OpenAlexaboutno aff
Jun Liu, Shengyang Zhou, Yehui Zhang, Lingdan Lian

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGuangdong Academy of Agricultural SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyPotato dextrose agarConidiumBotanyAlternaria alternataMyceliumLeaf spotSporeHorticultureHyphaOrnamental plantSpotsAgarBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elaeocarpus decipiens is widely cultivated as an ornamental tree of commercial importance in southern China. During March 2018 to March 2021, leaf spot disease was observed in about 40% of E. decipiens on the campus of Jiangnan University in Wuxi, Jiangsu, China (31.48°N, 120.46°E). Leaf symptoms began as small, light brown lesions that enlarged, turned olive brown in color and then became necrotic. Ten symptomatic leaves were collected from five different trees on the Jiangnan University campus and surface sterilized with 75% ethanol for 30 seconds, followed by 1% sodium hypochlorite for 1 minute, and rinsed three times with sterile distilled water before being cultured onto potato dextrose agar and incubated in the dark at 25°C for 5 days. Five purified fungal isolates were obtained by the single spore isolation method. Emergent fungal colonies were olive-green in color with 1 to 3 mm white margins and abundant aerial hyphae. Conidia were borne in chains or singly and were obclavate or obpyriform and measured 6.5 to 17.4 × 21.3 to 32.8 μm (n=50) with one to seven transverse septa and zero to three longitudinal septa. Based on morphological characteristics, the pathogen was identified as Alternaria spp.(Simmons 2007). Three representative isolates, At1, At2 and At3, were selected for molecular identification, total genomic DNA of the fungus isolates were extracted with Plant/Fungi DNA Isolation Kit (Sigma-Aldrich, Ontario, Canada). Plasma membrane ATPase (ATP) gene, chitin synthase (CHS) gene and translation elongation factor 1-alpha (EF1) gene were amplified with primers ATPDF1/ATPDR1, CHS-79F/CHS-345R (Lawrence et al. 2013) and EF1-728F/EF1-986R (Carbone and Kohn 1999). The amplification results of the three isolate genes were consistent, and we deposited the results of the ATP (MN046377), CHS (MN046378) and EF1 (MN046379) sequences of At1 in the NCBI GeneBank. The ATPase gene from the representative isolate At1 shared 99.83% similarity to A. alternata causing leaf Spot of Codonopsis pilosula in China (OM362504, Shi et al. 2022), the CHS gene shared 100% similarity to A. alternata causing brown leaf spot on Paris polyphylla var. chinensis in China (MK391053, Fu et al. 2019), and the EF1 gene shared 100% similarity to A. alternata CBS 916.96 ex-type on Arachis hypogaea in India (KC584634). A phylogenetic tree constructed with the EF1 gene using the neighbor-joining algorithm in MEGA 11 software with 1,000 bootstrap replicates revealed that the examined isolate, At1, belongs to the fungus A. alternata. For pathogenicity tests, 10 leaves of five healthy plants were sprayed with spore suspensions (1 × 107 conidia/ml) of the 10-day-old isolates (At1, At2 and At3, respectively). As a control, five plants were sprayed with sterile distilled water. After inoculation, use the bags to moisturize for 48 hours. Pathogenicity tests were conducted three times. Fourteen days after inoculation, olive brown necrotic lesions developed on inoculated leaves while control leaves remained symptomless. The pathogen was reisolated from infected leaves and confirmed as A. alternata based on morphological characteristics and molecular markers. To date, A. alternata has been reported to cause leaf spot disease on many plants inculuding Ficus religiosa (Du et al. 2022), Tilia miqueliana (Yue et al. 2023), Ligustrum japonicum (Fang et al. 2023) and so on. To our knowledge, this is the first report of the occurrence of A. alternata causing leaf spot on E. decipiens in China. The increasing area of E. decipiens cultivation and global climate change have led to an increase in the incidence of E. decipiens diseases, which should be taken into account by forest conservationists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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