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Enregistrement W4391282252 · doi:10.1111/bjh.19308

Variant <scp>ALK</scp>‐fusion positive anaplastic large cell lymphoma (<scp>ALCL</scp>): A population‐based paediatric study of the <scp>NHL‐BFM</scp> study group

2024· article· en· W4391282252 sur OpenAlexaff
Jette Luedersen, Udo zur Stadt, Julia Richter, Ilske Oschlies, Wolfgang Hiddemann, Andreas Rosenwald, Markéta Kalinová, Ingrid Simonitsch‐Klupp, Reiner Siebert, Martin Zimmermann, Minyue Qi, Jacqueline Nakel, Katrin Scheinemann, Fabian Knörr, Andishe Attarbaschi, Edita Kabíčková, Wilhelm Woessmann, Christine Damm‐Welk

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Haematology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityMcMaster Children's Hospital
Organismes subventionnairesDeutsche Kinderkrebsstiftung
Mots-clésAnaplastic large-cell lymphomaAnaplastic lymphoma kinaseNPM1LymphomaFusion genePopulationMedicineCancer researchOncologyBiologyInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Frequency, distribution and prognostic meaning of ALK-partner genes other than NPM1 in ALK-positive anaplastic large-cell lymphoma (ALCL) are unknown. Forty-nine of 316 ALCL diagnosed in the NHL-BFM study group showed no nuclear ALK expression suggestive of a variant ALK-partner; 41 were analysed by genomic capture high-throughput sequencing or specific RT-PCRs. NPM1::ALK was detected in 13 cases. Among the 28 patients with a non-NPM1::ALK-fusion partner, ATIC (n = 8; 29%) and TPM3 (n = 9; 32%) were the most common. Five of eight patients with ATIC::ALK-positive ALCL relapsed, none of nine with TPM3::ALK. Variant ALK-partners are rare and potentially associated with different prognoses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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