RADseq data reveal widespread historical introgression in four familiar North American songbirds
Notice bibliographique
Résumé
Population genetic structure is influenced by a combination of contemporary and historical events; however, this structure can be complicated by ongoing gene flow. While it is well known that contemporary hybridization occurs frequently among many closely related species, it often remains uncertain as to which populations are involved in introgression events, and this can be even more difficult to infer when introgression is historical. Here we use restriction-site associated DNA sequencing to look at the level of introgression among four species of songbirds in North America: the black-capped, mountain, boreal, and chestnut-backed chickadee. Samples from both sympatric and allopatric sites across the species' ranges supported limited ongoing mixing among the four species with Bayesian clustering and principal component analyses. In contrast, f4-statistics and admixture graphs revealed extensive historical introgression among geographically structured populations. Almost all historical admixture events were among populations west of the Rocky Mountains, and almost all populations west of the Rocky Mountains, excluding island and coastal populations, showed evidence of historical admixture. The inclusion of all four chickadee species proved crucial in differentiating which species were involved in hybridization events to avoid erroneous conclusions. Taken together, the results suggest a complex pattern of divergence with gene flow.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».