A compact regulatory RNA element in mouse Hsp70 mRNA
Notice bibliographique
Résumé
Hsp70 (70 kDa heat shock protein) performs molecular chaperone functions by assisting the folding of newly synthesized and misfolded proteins, thereby counteracting various cell stresses and preventing multiple diseases, including neurodegenerative disorders and cancers. It is well established that, immediately after heat shock, Hsp70 gene expression is mediated by a canonical mechanism of cap-dependent translation. However, the molecular mechanism of Hsp70 expression during heat shock remains elusive. Intriguingly, the 5' end of Hsp70 messenger RNA (mRNA) appears to form a compact structure with the potential to regulate protein expression in a cap-independent manner. Here, we determined the minimal length of the mHsp70 5'-terminal mRNA sequence that is required for RNA folding into a highly compact structure. This span of this RNA element was mapped and the secondary structure characterized by chemical probing, resulting in a secondary structural model that includes multiple stable stems, including one containing the canonical start codon. All of these components, including a short stretch of the 5' open reading frame (ORF), were shown to be vital for RNA folding. This work provides a structural basis for future investigations on the role of translational regulatory structures in the 5' untranslated region and ORF sequences of Hsp70 during heat shock.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».