MEDIATOR SUBUNIT 25 modulates ERFVII-controlled hypoxia responses in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Flooding impairs plant growth through oxygen deprivation, which activates plant survival and acclimation responses. Low-oxygen responses are generally associated with activation of group VII ETHYLENE-RESPONSE FACTOR (ERFVII) transcription factors. However, mechanism and molecular components by which ERFVII factors initiate gene expression are not fully elucidated. Here, we show that the Mediator complex subunit At MED25 is recruited by RELATED TO APETALA 2.2 (RAP2.2) and RAP2.12 to coordinate gene expression during hypoxia in Arabidopsis thaliana .. The med25 mutants display reduced low-oxygen stress tolerance. At MED25 associates with several ERFVII-controlled hypoxia core genes and its loss impairs transcription under hypoxia due to decreasing RNA polymerase II recruitment. Protein complex pulldown assays demonstrate that the Mediator complex built around At MED25 is adjusted under low-oxygen conditions. Moreover, during hypoxia, no functional cooperation between At MED25 and the two subunits At MED8 and At MED16 occurs, contrasting previous observations made for other conditions. In addition, At MED25 function under hypoxia is independent from ethylene signalling. Finally, a functional conservation at the molecular level was found for the MED25-ERFVII module between Arabidopsis thaliana and the monocot Oryza sativa , pointing to a potentially universal role of MED25 in enabling ERFVII-dependent transcript responses to hypoxia in plants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».