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Enregistrement W4391343466 · doi:10.1101/gr.278326.123

Oxidative stress accelerates intestinal tumorigenesis by enhancing 8-oxoguanine-mediated mutagenesis in MUTYH-deficient mice

2024· article· en· W4391343466 sur OpenAlexfundno aff
Mizuki Ohno, Noriko Takano, Kyoko Hidaka, Fumiko Sasaki, K. Yamauchi, Yasunobu Aoki, Takehiko Nohmi, Yusaku Nakabeppu, Yoshimichi Nakatsu, Teruhisa Tsuzuki

Notice bibliographique

RevueGenome Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceResearch Organization of Information and Systems
Mots-clésBiologyMUTYHOxidative stressMutagenesisCarcinogenesisGeneticsOxidative phosphorylationCancer researchMutationDNA glycosylaseCell biologyMolecular biologyDNA damageBiochemistryDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxidative stress–induced DNA damage and its repair systems are related to cancer etiology; however, the molecular basis triggering tumorigenesis is not well understood. Here, we aimed to explore the causal relationship between oxidative stress, somatic mutations in pre-tumor-initiated normal tissues, and tumor incidence in the small intestines of MUTYH-proficient and MUTYH-deficient mice. MUTYH is a base excision repair enzyme associated with human colorectal cancer. Mice were administered different concentrations of potassium bromate (KBrO 3 ; an oxidizing agent)–containing water for 4 wk for mutagenesis studies or 16 wk for tumorigenesis studies. All Mutyh −/− mice treated with >0.1% KBrO 3 developed multiple tumors, and the average tumor number increased dose dependently. Somatic mutation analysis of Mutyh −/− / rpsL transgenic mice revealed that G:C > T:A transversion was the only mutation type correlated positively with KBrO 3 dose and tumor incidence. These mutations preferentially occurred at 5′G in GG and GAA sequences in rpsL . This characteristic mutation pattern was also observed in the genomic region of Mutyh −/− tumors using whole-exome sequencing. It closely corresponded to signature 18 and SBS36, typically caused by 8-oxo-guanine (8-oxoG). 8-oxoG-induced mutations were sequence context dependent, yielding a biased amino acid change leading to missense and stop-gain mutations. These mutations frequently occurred in critical amino acid codons of known cancer drivers, Apc or Ctnnb1 , known for activating Wnt signal pathway. Our results indicate that oxidative stress contributes to increased tumor incidence by elevating the likelihood of gaining driver mutations by increasing 8-oxoG-mediated mutagenesis, particularly under MUTYH-deficient conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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