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Enregistrement W4391384681 · doi:10.1136/bjsports-2023-concussion.211

2.20 Statistical modelling of blood biomarkers of sport-related concussion: can we improve estimate precision by using all sample replicates instead of means and >20%CV data exclusion?

2024· article· en· W4391384681 sur OpenAlexaffabout
Jason Tabor, Linden C. Penner, Jean‐Michel Galarneau, Jennifer Cooper, Mohammad Ghodsi, Douglas D. Fraser, Carolyn A. Emery, Cheryl L. Wellington, Chantel T. Debert

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury Research
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerReplicateStatisticsRegression analysisInternal medicineMedicineCohortMathematicsChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To investigate agreement between plasma biomarker measurements run in duplicate and explore the precision of statistical modelling approaches using all replicate data vs standard of practice sample means and >20%CV data exclusion. Design Cohort study. Setting Canadian high-school and community sport settings. Participants Healthy youth athletes participating in the SHRed Concussions study (n=149, 48% female, ages 11–17). Assessment of Risk Factors Previous concussion (Yes/No), age (years), and sex (M/F). Outcome Measures Plasma GFAP, NF-L, UCH-L1, T-tau, and ptau-181 concentrations (SIMOA;Quanterix) were examined. 95% limits of agreement (95%LOA) between biomarker replicates were assessed using Bland-Altman (B-A) analysis. Three multivariable regression models (α=0.05) were performed to assess estimates of association between independent variables and natural-log (ln) transformed biomarker levels. Model 1 (M1): multi-level model, all replicate data; Model 2 (M2): means of replicates; Model 3 (M3): means of replicates, excluding pairs >20%CV. Main Results B-A showed 95%LOA in GFAP (-17.74;18.2 pg/mL), UCH-L1 (-13.77;14.82 pg/mL), NF-L (-1.871;1.801 pg/mL), ptau-181 (-0.5314;0.5391 pg/mL) and T-tau (ln-T-tau back-transformed ratio 65.27%;150.03%). Biomarker-specific regression β-estimates differed between M1–3 for each biomarker (largest difference in M3 given data exclusion >20%CV). Age was associated with ln-UCH-L1 in M2 (β=0.0485; 95%CI:0.0006,0.0964). Sex was associated with ln-NF-L [(M1:β=0.1940; 95%CI:0.0135,0.3745); (M2:β=0.1945; 95%CI:0.0105,0.3786)] and ln-GFAP [(M1:β=-0.1676; 95%CI:-0.3037,-0.0315); (M2:β=-0.1668; 95%CI:-0.3066,-0.0270) in M1–2. M1 displayed narrowest 95%CIs (highest estimate precision). Conclusions Wide 95%LOA in baseline blood biomarkers suggest the mean of sample duplicates may not reflect true population values. Future pediatric sport-related concussion studies may benefit from statistical modelling incorporating all replicate biomarker data to increase estimate accuracy and precision while considering the importance of age and sex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,215
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,359
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2150,359
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0050,003
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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