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Enregistrement W4391397818 · doi:10.1101/2024.01.30.577898

Synthesis and application of a photocaged L-lactate

2024· preprint· en· W4391397818 sur OpenAlexaff
Ikumi Miyazaki, Kelvin Tsao, Yuki Kamijo, Yusuke Nasu, Takuya Terai, Robert E. Campbell

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiquePhotochromic and Fluorescence Chemistry
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of Tokyo
Mots-clésChemistryGlycolysisMetaboliteBiochemistryIntracellularMetabolismCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract l -Lactate, once considered a metabolic waste product of glycolysis, is now recognized as a vitally important metabolite and signaling molecule in multiple biological pathways. However, exploring l -lactate’s emerging intra- and extra-cellular roles is hindered by a lack of tools to locally perturb l -lactate concentration intracellularly and extracellularly. Photocaged compounds are a powerful way to introduce bioactive molecules with spatial and temporal precision using illumination. Here, we report the development of a photocaged derivative of l -lactate, 4-methoxy-7-nitroindolinyl l -lactate (MNI- l -lac), that releases l -lactate upon UV illumination. We validated MNI- l -lac in cell culture by demonstrating that the photorelease of l -lactate elicits a response from genetically encoded extra- and intracellular l -lactate biosensors. These results indicate that MNI- l -lac may be useful for perturbing the concentration of endogenous l -lactate in order to investigate l -lactate’s roles in metabolism and signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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