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Enregistrement W4391451082 · doi:10.3168/jdsc.2023-0431

Development of genomic evaluation for methane efficiency in Canadian Holsteins

2024· review· en· W4391451082 sur OpenAlexafffundabout
Hinayah Rojas de Oliveira, Hannah Sweett, Saranya G. Narayana, A. Fleming, Saeed Shadpour, F. Malchiodi, J. Jamrozik, G.J. Kistemaker, P G Sullivan, Flávio S. Schenkel, Dagnachew Hailemariam, Paul Stothard, Graham Plastow, Brian Van Doormaal, Michael Lohuis, Jay Shannon, Christine F. Baes, F. Miglior

Notice bibliographique

RevueJDS Communications · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesGenome AlbertaGenome British ColumbiaUniversity of AlbertaGenome CanadaOntario GenomicsUniversity of Guelph
Mots-clésBreedTraitSelection (genetic algorithm)Restricted maximum likelihoodGenomic selectionPopulationYield (engineering)BiotechnologyProduction (economics)Animal breedingDairy cattleBiologyGenetic gainAnimal scienceGreenhouse gasEnvironmental scienceStatisticsMathematicsGenetic variationEcologyGeneticsGeneComputer scienceMaximum likelihoodGenotypeEconomicsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reducing methane (CH 4 ) emissions from agriculture, among other sectors, is a key step to reduce global warming. There are many strategies to reduce CH 4 emissions in ruminant animals, including genetic selection, which yields cumulative and permanent genetic gains over generations. A single-step genomic evaluation for Methane Efficiency (ME) was officially implemented in April 2023 for the Canadian Holstein breed, aiming to reduce CH 4 emissions without impacting production levels. This evaluation was achieved by using milk mid-infrared (MIR) spectral data to predict individual cow CH 4 production. The genetic evaluation model included milk MIR predicted CH 4 (CH4 MIR ), along with milk yield (MY), fat yield (FY), and protein yield (PY), as correlated traits. Traits were expressed in kg/day (MY, FY, and PY) or g/day (CH4 MIR ). The MiX99 software was used to fit the single-step, 4-trait animal model. Genomic breeding values for CH4 MIR were then obtained by re-parameterization, using recursive genetic linear regression coefficients on MY, FY, and PY, giving a measure of ME that is genetically independent of the production traits. The estimated breeding values were expressed as Relative Breeding Values (RBV) with a mean of 100 and standard deviation of 5 for the genetic base population, where a higher value indicates the animal produces lower predicted CH 4 . This national genomic evaluation is another tool that will lower the dairy industry's carbon footprint by reducing CH 4 emissions without impacting production traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,239
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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