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Enregistrement W4391467155 · doi:10.1093/jeb/voae017

Jump dispersal drives the relationship between micro- and macroevolutionary dynamics in the Sicydiinae (Gobiiformes: Oxudercidae) of Sundaland and Wallacea

2024· article· en· W4391467155 sur OpenAlexafffund
Tom Jamonneau, Hadi Dahruddin, Gino V. Limmon, Tedjo Sukmono, F. Busson, Nurjirana Nurjirana, Abdul Gani, Jesaya Patikawa, Erwin Wuniarto, Sopian Sauri, Ujang Nurhaman, Daisy Wowor, Dirk Steinke, Philippe Keith, Nicolas Hubert

Notice bibliographique

RevueJournal of Evolutionary Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFish Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundLembaga Ilmu Pengetahuan IndonesiaInstitut de Recherche pour le Développement
Mots-clésBiologyBiological dispersalPhylogeographyEcologyCoalescent theoryBiodiversity hotspotPopulationGenetic diversityBiodiversityIntraspecific competitionEvolutionary biologyAllopatric speciationZoologyPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Insular biodiversity hotspots of Southeast Asia are remarkable for their biodiverse faunas. With a marine larval phase lasting up to several months, the freshwater fish subfamily Sicydiinae has colonized most islands of these hotspots. However, Sicydiinae diversity is still poorly understood in Southeast Asia. With the objective of estimating intraspecific genetic diversity and inferring past demography, we conducted the molecular inventory of Sicydiinae species in Sundaland and Wallacea using 652 bp of the mitochondrial cytochrome oxidase I gene, species delimitation methods, and Bayesian Skyline plot reconstructions. In total, 24 Molecular Operational Taxonomic Units are delimited among the 603 sequences belonging to 27 species and 5 genera. Two cases of discordance between morphology and mitochondrial sequence are observed, suggesting ongoing speciation and/or introgression in 2 genera. Multiple new occurrences are reported, either for a single biodiversity hotspot or both, some of which correspond to observations of a few individuals far from the range distribution of their conspecifics. Among the 10 species or species groups whose intraspecific diversity was examined, high levels of genetic diversity and past population expansion are revealed by Tajima's D tests and Bayesian Skyline Plot reconstructions. Together, these results indicate that long-distance dispersal is common and suggest that most endemic species originated through founder events followed by population expansion. Patterns of sexual dimorphism and males' coloration among diverging species pairs seem to point to sexual selection as an important mechanism contributing to speciation in the Sicydiinae of Sundaland and Wallacea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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