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Enregistrement W4391481307 · doi:10.1016/j.isci.2024.109081

A machine learning algorithm for peripheral artery disease prognosis using biomarker data

2024· article· en· W4391481307 sur OpenAlexaff
Ben Li, Farah Shaikh, Abdelrahman Zamzam, Muzammil H. Syed, Rawand Abdin, Mohammad Qadura

Notice bibliographique

RevueiScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeripheral Artery Disease Management
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerProspective cohort studyMedicineCohortMachine learningInternal medicineAlgorithmPeripheralComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peripheral artery disease (PAD) biomarkers have been studied in isolation; however, an algorithm that considers a protein panel to inform PAD prognosis may improve predictive accuracy. Biomarker-based prediction models were developed and evaluated using a model development (n = 270) and prospective validation cohort (n = 277). Plasma concentrations of 37 proteins were measured at baseline and the patients were followed for 2 years. The primary outcome was 2-year major adverse limb event (MALE; composite of vascular intervention or major amputation). Of the 37 proteins tested, 6 were differentially expressed in patients with vs. without PAD (ADAMTS13, ICAM-1, ANGPTL3, Alpha 1-microglobulin, GDF15, and endostatin). Using 10-fold cross-validation, we developed a random forest machine learning model that accurately predicts 2-year MALE in a prospective validation cohort of PAD patients using a 6-protein panel (AUROC 0.84). This algorithm can support PAD risk stratification, informing clinical decisions on further vascular evaluation and management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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