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Enregistrement W4391519957 · doi:10.1186/s12938-023-01174-z

Detecting bulbar amyotrophic lateral sclerosis (ALS) using automatic acoustic analysis

2024· article· en· W4391519957 sur OpenAlexafffund
Leif Simmatis, Jessica Robin, Michael J. Spilka, Yana Yunusova

Notice bibliographique

RevueBioMedical Engineering OnLine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensSunnybrook HospitalToronto Rehabilitation InstituteUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsALS Society of Canada
Mots-clésAmyotrophic lateral sclerosisMedicineReceiver operating characteristicLogistic regressionInterquartile rangeAudiologyDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Automatic speech assessments have the potential to dramatically improve ALS clinical practice and facilitate patient stratification for ALS clinical trials. Acoustic speech analysis has demonstrated the ability to capture a variety of relevant speech motor impairments, but implementation has been hindered by both the nature of lab-based assessments (requiring travel and time for patients) and also by the opacity of some acoustic feature analysis methods. These challenges and others have obscured the ability to distinguish different ALS disease stages/severities. Validation of automated acoustic analysis tools could enable detection of early signs of ALS, and these tools could be deployed to screen and monitor patients without requiring clinic visits. Here, we sought to determine whether acoustic features gathered using an automated assessment app could detect ALS as well as different levels of speech impairment severity resulting from ALS. Speech samples (readings of a standardized, 99-word passage) from 119 ALS patients with varying degrees of disease severity as well as 22 neurologically healthy participants were analyzed, and 53 acoustic features were extracted. Patients were stratified into early and late stages of disease (ALS-early/ALS-E and ALS-late/ALS-L) based on the ALS Functional Ratings Scale-Revised bulbar score (FRS-bulb) (median [interquartile range] of FRS-bulbar scores: 11[3]). The data were analyzed using a sparse Bayesian logistic regression classifier. It was determined that the current relatively small set of acoustic features could distinguish between ALS and controls well (area under receiver-operating characteristic curve/AUROC = 0.85), that the ALS-E patients could be separated well from control participants (AUROC = 0.78), and that ALS-E and ALS-L patients could be reasonably separated (AUROC = 0.70). These results highlight the potential for automated acoustic analyses to detect and stratify ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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