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Enregistrement W4391526988 · doi:10.1016/j.cstres.2023.12.002

J-domain proteins: From molecular mechanisms to diseases

2024· article· en· W4391526988 sur OpenAlexaff
Jarosław Marszałek, Paolo De Los Rios, Douglas Cyr, Matthias P. Mayer, Vasista Adupa, Claes Andréasson, Gregory L. Blatch, Janice E.A. Braun, Jeffrey L. Brodsky, Bernd Bukau, J. Paul Chapple, Charlotte Conz, Sébastien Dementin, Pierre Genevaux, Olivier Genest, Pierre Goloubinoff, Jason E. Gestwicki, Colin M. Hammond, Justin K. Hines, Koji Ishikawa, Łukasz A. Joachimiak, Janine Kirstein, Krzysztof Liberek, Dejana Mokranjac, Nadinath B. Nillegoda, Carlos H.I. Ramos, Mathieu E. Rebeaud, David Ron, Sabine Rospert, Chandan Sahi, Reut Shalgi, Bartłomiej Tomiczek, Ryo Ushioda, Elizaveta Ustyantseva, Yihong Ye, Maciej Żylicz, Harm H. Kampinga

Notice bibliographique

RevueCell Stress and Chaperones · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of General Medical SciencesAtaxia UK
Mots-clésDomain (mathematical analysis)Function (biology)Computational biologyBiologyComputer scienceEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

J-domain proteins (JDPs) are the largest family of chaperones in most organisms, but much of how they function within the network of other chaperones and protein quality control machineries is still an enigma. Here, we report on the latest findings related to JDP functions presented at a dedicated JDP workshop in Gdansk, Poland. The report does not include all (details) of what was shared and discussed at the meeting, because some of these original data have not yet been accepted for publication elsewhere or represented still preliminary observations at the time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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