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Enregistrement W4391575113 · doi:10.1093/jsxmed/qdae001.054

(058) Detection and Transcriptional Profiling of Mesenchymal Stem Cells in Peyronie’s Plaque Explants

2024· article· en· W4391575113 sur OpenAlexaff
LR Garabed, Luke Witherspoon, R Soltani, Michael Robinson, Morgan E. Roberts, Faraz Hach, Ryan Flannigan

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Sexual Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSexual function and dysfunction studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaOttawa HospitalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMesenchymal stem cellPeyronie's diseaseMyofibroblastFlow cytometryPathologyGene expressionGene expression profilingBiologyCell biologyMedicineMolecular biologyGeneDiseaseFibrosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction The mechanisms behind the pathogenesis of Peyronie’s disease largely remain a mystery. Plaques have largely been thought to be derived from epithelial to mesenchymal transformation of fibroblasts to myofibroblasts. Objective We sought to transcriptomically profile explanted cells from Peyronie’s plaques and evaluate their profiles with transforming growth factor B (TGF-B) stimulation. Methods Peyronie’s plaque were excised from 3 patients undergoing penile incision and grafting surgery. Cells were explanted from biopsy tissue and propagated. Cells were profiled using single cell RNA sequencing (scRNAseq). These cells were then exposed to TGF-□ to simulate the active phase of Peyronie’s disease, and profiled with scRNAseq at baseline and 24 hours following TGF-□□ stimulation. We used principle component analysis (PCA) to reduce the dimension of data and built the nearest-neighbors graph using PCA weights. We performed clustering over the nearest-neighbor graph and visualized the clusters using UMAP algorithm. Differential gene expression and pathway analyses were performed using the top 50 genes with increased expression between 0- and 24-hour time points. Multi-channel flow cytometry and immunofluorescence were used for mesenchymal stem cell (MSC) phenotypic validation. Results Assessment of cell clustering identified profiles of fibroblasts, myofibroblasts, smooth muscle, and mesenchymal stem-like cells. We further confirmed rare presence of mesenchymal stem cells using multi-channel flow cytometry in our cultured cells and plaque biopsies. Differential gene expression of the 50 genes showing the greatest induction showed that genes involved in cellular binding and catalytic activity were most commonly upregulated following introduction of TGF-B. Conclusions This analysis provides unique insight into the expression profiles of Peyronie’s plaque cell populations explanted in culture and stimulated via TGF-B to activate myofibroblasts akin to the active phase of Peyronie’s disease. Using the information gained from this single-cell RNA sequencing analysis ongoing efforts can be performed to identify therapeutic targets for active phase Peyronie’s disease. Disclosure Any of the authors act as a consultant, employee or shareholder of an industry for: Coloplast; Boston; Teumo Health Technologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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