Synthetic data in cancer and cerebrovascular disease research: A novel approach to big data
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Synthetic datasets are artificially manufactured based on real health systems data but do not contain real patient information. We sought to validate the use of synthetic data in stroke and cancer research by conducting a comparison study of cancer patients with ischemic stroke to non-cancer patients with ischemic stroke. DESIGN: retrospective cohort study. SETTING: We used synthetic data generated by MDClone and compared it to its original source data (i.e. real patient data from the Ottawa Hospital Data Warehouse). OUTCOME MEASURES: We compared key differences in demographics, treatment characteristics, length of stay, and costs between cancer patients with ischemic stroke and non-cancer patients with ischemic stroke. We used a binary, multivariable logistic regression model to identify risk factors for recurrent stroke in the cancer population. RESULTS: Using synthetic data, we found cancer patients with ischemic stroke had a lower prevalence of hypertension (52.0% in the cancer cohort vs 57.7% in the non-cancer cohort, p<0.0001), and a higher prevalence of chronic obstructive pulmonary disease (COPD: 8.5% vs 4.7%, p<0.0001), prior ischemic stroke (1.7% vs 0.1%, p<0.001), and prior venous thromboembolism (VTE: 8.2% vs 1.5%, p<0.0001). They also had a longer length of stay (8 days [IQR 3-16] vs 6 days [IQR 3-13], p = 0.011), and higher costs associated with their stroke encounters: $11,498 (IQR $4,440 -$20,668) in the cancer cohort vs $8,084 (IQR $3,947 -$16,706) in the non-cancer cohort (p = 0.0061). A multivariable logistic regression model identified 5 predictors for recurrent ischemic stroke in the cancer cohort using synthetic data; 3 of the same predictors identified using real patient data with similar effect measures. Summary statistics between synthetic and original datasets did not significantly differ, other than slight differences in the distributions of frequencies for numeric data. CONCLUSION: We demonstrated the utility of synthetic data in stroke and cancer research and provided key differences between cancer and non-cancer patients with ischemic stroke. Synthetic data is a powerful tool that can allow researchers to easily explore hypothesis generation, enable data sharing without privacy breaches, and ensure broad access to big data in a rapid, safe, and reliable fashion.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,023 | 0,087 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».