Population genomics of coastal Pacific Hake
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Objective Understanding the genetic structure of harvested fishery species is crucial for accurate stock assessments and effective management strategies. There have been several rangewide population genetic analyses of Pacific Hake Merluccius productus; however, a thorough focus on the heavily harvested coastal stock off the west coast of North America is missing. Recent observations of spatial–temporal variability in life history and migratory patterns of the coastal population have brought into question whether this variation may be related to genetic differentiation. Methods Here, we used restriction site-associated DNA sequencing markers to thoroughly assess the potential for spatial–temporal genetic differentiation in the coastal stock of Pacific Hake. We sampled during different seasons from British Columbia down to the U.S.–Mexico border over multiple years on what traditionally have been thought to constitute spawning and feeding grounds, resulting in the most comprehensive assessment of coastal Pacific Hake population structure to date. Result Generally, our results suggest very weak to no structure among coastal spatial–temporal sites and corroborate previous findings of strong differentiation between coastal and Salish Sea populations. The lack of structure among coastal sites is likely due to significant amounts of gene flow in this highly migratory population. Conclusion These findings align with the ongoing management strategy for coastal Pacific Hake, which is based on an annual stock assessment that considers the coastal stock homogenous and distinct from the Salish Sea population. The understanding that management units indeed match genetic populations provides managers with additional confidence in existing management strategy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».