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Enregistrement W4391609482 · doi:10.3389/fmolb.2024.1360267

Editorial: Progress and challenges in computational structure-based design and development of biologic drugs

2024· editorial· en· W4391609482 sur OpenAlexaff
Traian Sulea, Sandeep Kumar, Daisuke Kuroda

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2024
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputational biologyComputer scienceNanotechnologyBiochemical engineeringBiologyEngineeringMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biotherapeutics have emerged as a major class of pharmaceuticals, encompassing monoclonal antibodies, recombinant human proteins and enzymes, fusion proteins, antibody drug conjugates, multi-specific formats, peptides, and vaccines. These modalities serve a wide range of therapeutic areas, including immune-oncology, inflammation, cardiovascular, metabolic, infectious, and rare diseases (DeFrancesco, 2019; Kang and Jung, 2020; Lu et al., 2020; Kaplon et al., 2023). Recent advancements in structure determination, structure prediction, bioanalytical characterization, and machine learning have established in silico approaches as a key toolbox employed in the biologic drug discovery and development pipelines (Fischman and Ofran, 2018; Norman et al., 2020; Fernandez-Quintero et al., 2023). Additionally, physics-based molecular modeling and simulation methods, along with empirical linear models, have matured to routine implementation during biotherapeutic drug candidate selection and optimization. However, the accuracy of these predictions can be improved. Further refinements will be welcomed, particularly towards binding affinity predictions and developability assessments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,525
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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