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Enregistrement W4391619434 · doi:10.1002/oto2.101

Evaluating Sinus Microbiology by Transplant Status in Persons With Cystic Fibrosis: A Matched Cohort Study

2024· article· en· W4391619434 sur OpenAlexaff
Ranjani Somayaji, Christina S. Thornton, Nicole Acosta, Kristine A. Smith, Jessica Clark, Linda Fatovich, Mitesh V. Thakrar, Michael D. Parkins

Notice bibliographique

RevueOTO Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosisSputumMicrobiomeMedicineInternal medicineChronic rhinosinusitisProspective cohort studySinus (botany)BronchiectasisGastroenterologyPathologyBiologyBioinformaticsLungEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Sinus disease is prevalent in persons with cystic fibrosis (PwCF) and may be a reservoir of airway infection in postlung transplant (pTx) patients. The microbial composition of cystic fibrosis sinuses and its associations with chronic rhinosinusitis (CRS) is relatively unexplored. We aimed to examine the sinus and lower airway microbiome and their associations with CRS in PwCF and pTxPwCF. Study Design Prospective single‐centre study. Setting A total of 31 sex and age (±2 years) matched PwCF and pTxPwCF. Methods Demographic and clinical data along with sinus swabs and sputum were collected. CRS was assessed using Sinonasal Outcome Test‐22 (SNOT‐22) (patient reported outcome) and Lund‐McKay (computed tomography sinus) scores. Samples underwent MiSeq Illumina sequencing of the universal 16S ribosomal RNA gene. Results A total of 31 PwCF (15 pTxPwCF) were included. Aggregate airways microbiome composition was dominated by Pseudomonas (46%), Haemophilus (14%), Staphylococcus (11%), Streptococcus (10%), and Fusobacterium (6%). α‐diversity was significantly lower in post‐Tx samples across both sputum and sinus samples ( P = .005). β‐diversity was significantly different between sputum ( P = .004), but not sinus ( P = .75) samples by transplant status. While there was a trend in higher β‐diversity associated with lower SNOT‐22 score at time of first visit, this did not reach significance ( P = .05). Conclusion Sinus and airway microbiomes differed in PwCF and pTxPwCF, but the prevalent organisms remained consistent. Elucidating the relationship of the microbiome with clinical status to better understand when to intervene accordingly is needed to optimize sinus disease management in PwCF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,810

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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