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Enregistrement W4391645038 · doi:10.1128/mra.00980-23

Whole community shotgun metagenomes of two biological soil crust types from the Mojave Desert

2024· article· en· W4391645038 sur OpenAlexfundno aff
T. Nguyen, Nuttapon Pombubpa, Marcel Huntemann, Alicia Clum, Brian Foster, Bryce Foster, Simon Roux, Krishna Palaniappan, Neha Varghese, Supratim Mukherjee, T. B. K. Reddy, Chris Daum, Alex Copeland, I-Min A. Chen, Natalia Ivanova, Nikos C. Kyrpides, Miranda Harmon‐Smith, Emiley A. Eloe‐Fadrosh, Nicole Pietrasiak, Jason Stajich, Erik Hom

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Resource Announcements · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBiocrusts and Microbial Ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureNational Energy Research Scientific Computing CenterJoint Genome InstituteCanadian Institute for Advanced ResearchNational Science FoundationIowa State UniversityOffice of ScienceU.S. Department of AgricultureU.S. Department of Energy
Mots-clésDesert (philosophy)EcotoneMetagenomicsEcologyEcosystemCrustEarth scienceEnvironmental scienceGeographyGeologyHabitatBiologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present six whole community shotgun metagenomic sequencing data sets of two types of biological soil crusts sampled at the ecotone of the Mojave Desert and Colorado Desert in California. These data will help us understand the diversity and function of biocrust microbial communities, which are essential for desert ecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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