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Enregistrement W4391645268 · doi:10.1002/gcc.23221

Segregation, immunohistochemical, molecular and functional analyses classify a novel missense variant in fumarate hydratase (<scp><i>FH</i></scp>) as pathogenic

2024· article· en· W4391645268 sur OpenAlexafffund
Lydia Ouchene, Blake R. Wilde, Fiona Chan‐Pak‐Choon, José Camacho Valenzuela, Fadi Brimo, Leora Witkowski, Heather R. Christofk, Céline Domecq, Lili Fu, Evan Weber, Brianna Lemieux Anglin, Elena Netchiporouk, William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMissense mutationBiologyGermlineGermline mutationGeneticsCancer researchPathologicalGeneCancerMutationPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC) is an autosomal dominant cancer predisposition syndrome characterized by cutaneous leiomyomas, uterine leiomyomas, and aggressive renal cancer. Germline variants in the fumarate hydratase (FH) gene predispose to HLRCC. Identifying germline pathogenic FH variants enables lifetime renal cancer screening and genetic testing for family members. In this report, we present a FH missense variant (c.1039T>C (p.S347P)), initially classified as a variant of uncertain significance. Clinical assessment, histopathological findings, molecular genetic studies, and enzymatic activity studies support the re-classification of the FH c.1039T>C variant to "pathogenic" based on ACMG/AMP criteria. Further insights into pathological recognition of FH-deficient renal cancer are discussed and should be recognized. This study has shown how (a) detailed multi-disciplinary analyses of a single variant can reclassify rare missense variants in FH and (b) careful pathological review of renal cancers is obligatory when HLRCC is suspected.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,165
Score d'incertitude au seuil0,856

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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