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Enregistrement W4391670666 · doi:10.1038/s41597-024-03739-6

MAPLES-DR: MESSIDOR Anatomical and Pathological Labels for Explainable Screening of Diabetic Retinopathy

2024· preprint· en· W4391670666 sur OpenAlex
Gabriel Lepetit-Aimon, Clément Playout, Marie Carole Boucher, Renaud Duval, Michael H. Brent, Farida Chériet

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalDiabetes Action Research and Education Foundation
Mots-clésPathologicalDiabetic retinopathyMedicineOphthalmologyPathologyDiabetes mellitusEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reliable automatic diagnosis of Diabetic Retinopathy (DR) and Macular Edema (ME) is an invaluable asset in improving the rate of monitored patients among at-risk populations and in enabling earlier treatments before the pathology progresses and threatens vision. However, the explainability of screening models is still an open question, and specifically designed datasets are required to support the research. We present MAPLES-DR (MESSIDOR Anatomical and Pathological Labels for Explainable Screening of Diabetic Retinopathy), which contains, for 198 images of the MESSIDOR public fundus dataset, new diagnoses for DR and ME as well as new pixel-wise segmentation maps for 10 anatomical and pathological biomarkers related to DR. This paper documents the design choices and the annotation procedure that produced MAPLES-DR, discusses the interobserver variability and the overall quality of the annotations, and provides guidelines on using the dataset in a machine learning context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,603
Score d'incertitude au seuil0,795

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle