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Enregistrement W4391677338 · doi:10.1038/s41598-024-53729-2

Sperm-specific histone H1 in highly condensed sperm nucleus of Sargassum horneri

2024· article· en· W4391677338 sur OpenAlexfundno aff
Yu Takeuchi, Shinya Sato, Chikako Nagasato, Taizo Motomura, Shujiro Okuda, Masahiro Kasahara, Fumio Takahashi, Shinya Yoshikawa

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceHokkaido UniversityChinese Academy of Sciences
Mots-clésFucalesSpermBiologyHistoneHistone H1ChromatinProphaseCell biologyHistone H2ABotanyGeneticsGeneAlgaeMeiosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spermatogenesis is one of the most dramatic changes in cell differentiation. Remarkable chromatin condensation of the nucleus is observed in animal, plant, and algal sperm. Sperm nuclear basic proteins (SNBPs), such as protamine and sperm-specific histone, are involved in chromatin condensation of the sperm nucleus. Among brown algae, sperm of the oogamous Fucales algae have a condensed nucleus. However, the existence of sperm-specific SNBPs in Fucales algae was unclear. Here, we identified linker histone (histone H1) proteins in the sperm and analyzed changes in their gene expression pattern during spermatogenesis in Sargassum horneri. A search of transcriptomic data for histone H1 genes in showed six histone H1 genes, which we named ShH1.1a, ShH1b, ShH1.2, ShH1.3, ShH1.4, and ShH1.5. Analysis of SNBPs using SDS-PAGE and LC-MS/MS showed that sperm nuclei contain histone ShH1.2, ShH1.3, and ShH1.4 in addition to core histones. Both ShH1.2 and ShH1.3 genes were expressed in the vegetative thallus and the male and female receptacles (the organs producing antheridium or oogonium). Meanwhile, the ShH1.4 gene was expressed in the male receptacle but not in the vegetative thallus and female receptacles. From these results, ShH1.4 may be a sperm-specific histone H1 of S. horneri.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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