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Enregistrement W4391738016 · doi:10.1101/2024.02.03.24302304

Predicting Time to Diabetes Diagnosis Using Random Survival Forests

2024· preprint· en· W4391738016 sur OpenAlexaffabout
Priyonto Saha, Yacine Marouf, Hunter Pozzebon, Aziz Guergachi, Karim Keshavjee, Mohammad Noaeen, Zahra Shakeri

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes, Cardiovascular Risks, and Lipoproteins
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversityTed Rogers Centre for Heart ResearchYork UniversityPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRandom forestConcordancePredictive modellingMachine learningMedicinePopulationComorbidityComputer scienceArtificial intelligenceDiabetes mellitusInternal medicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Type 2 Diabetes Mellitus (T2DM) is a chronic metabolic disorder with increasing population incidence. However, T2DM takes years to develop, allowing onset prediction and prevention to be a clinically effective treatment strategy. In this study we propose and assess a novel approach to diabetes prediction which integrates a specialized extension of the random forest algorithm known as random survival forest (RSF). Rather than predicting a binary outcome, this machine learning model incorporates survival analysis methodology to predict the time until a patient will receive a diabetes diagnosis if their current lifestyle is maintained. We trained a baseline model on 7,704 electronic medical records from the Canadian Primary Care Sentinel Surveillance Network (CPCSSN) with 14 biomarker and comorbidity features across different measurement dates. Although tuning parameters were purposefully chosen for quick training rather than for predictive performance, our model exceeded expectations with a concordance index of 0.84. Thus, RSF models have been shown to produce accurate timelines of diabetes onset trajectory, providing patients with quantifiable and relatable risks that are easy to understand. The results of our study have substantial implications for advancing machine learning in clinical decision support and patient outcome predictions, emphasizing the role of innovative models in improving predictive accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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