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Enregistrement W4391756326 · doi:10.1016/j.jclinepi.2024.111278

Grilling the data: application of specification curve analysis to red meat and all-cause mortality

2024· review· en· W4391756326 sur OpenAlexaff
Yumin Wang, Tyler Pitre, Joshua D. Wallach, Russell J. de Souza, Tanvir Jassal, Dennis M. Bier, Chirag J. Patel, Dena Zeraatkar

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Epidemiology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNutritional Studies and Diet
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismU.S. Food and Drug AdministrationYale UniversityNational Institutes of HealthNational Institute of Environmental Health SciencesArnold Ventures
Mots-clésCovariateStatisticsHazard ratioHazardObservational studyQuantileMedicineRed meatSpecificationEpidemiologyHazard analysisEconometricsComputer scienceMathematicsInternal medicinePathologyEngineeringConfidence intervalReliability engineeringBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To present an application of specification curve analysis-a novel analytic method that involves defining and implementing all plausible and valid analytic approaches for addressing a research question-to nutritional epidemiology. STUDY DESIGN AND SETTING: We reviewed all observational studies addressing the effect of red meat on all-cause mortality, sourced from a published systematic review, and documented variations in analytic methods (eg, choice of model, covariates, etc.). We enumerated all defensible combinations of analytic choices to produce a comprehensive list of all the ways in which the data may reasonably be analyzed. We applied specification curve analysis to data from National Health and Nutrition Examination Survey 2007 to 2014 to investigate the effect of unprocessed red meat on all-cause mortality. The specification curve analysis used a random sample of all reasonable analytic specifications we sourced from primary studies. RESULTS: Among 15 publications reporting on 24 cohorts included in the systematic review on red meat and all-cause mortality, we identified 70 unique analytic methods, each including different analytic models, covariates, and operationalizations of red meat (eg, continuous vs quantiles). We applied specification curve analysis to National Health and Nutrition Examination Survey, including 10,661 participants. Our specification curve analysis included 1208 unique analytic specifications, of which 435 (36.0%) yielded a hazard ratio equal to or more than 1 for the effect of red meat on all-cause mortality and 773 (64.0%) less than 1. The specification curve analysis yielded a median hazard ratio of 0.94 (interquartile range: 0.83-1.05). Forty-eight specifications (3.97%) were statistically significant, 40 of which indicated unprocessed red meat to reduce all-cause mortality and eight of which indicated red meat to increase mortality. CONCLUSION: We show that the application of specification curve analysis to nutritional epidemiology is feasible and presents an innovative solution to analytic flexibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,028
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,059
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0280,059
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,010
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,753
Tête enseignante GPT0,638
Écart entre enseignants0,115 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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