Evidence supports a causal association between allele-specific vitamin D receptor binding and multiple sclerosis among Europeans
Notice bibliographique
Résumé
Although evidence exists for a causal association between 25-hydroxyvitamin D (25(OH)D) serum levels, and multiple sclerosis (MS), the role of variation in vitamin D receptor (VDR) binding in MS is unknown. Here, we leveraged previously identified variants associated with allele imbalance in VDR binding (VDR-binding variant; VDR-BV) in ChIP-exo data from calcitriol-stimulated lymphoblastoid cell lines and 25(OH)D serum levels from genome-wide association studies to construct genetic instrumental variables (GIVs). GIVs are composed of one or more genetic variants that serve as proxies for exposures of interest. Here, GIVs for both VDR-BVs and 25(OH)D were used in a two-sample Mendelian Randomization study to investigate the relationship between VDR binding at a locus, 25(OH)D serum levels, and MS risk. Data for 13,598 MS cases and 38,887 controls of European ancestry from Kaiser Permanente Northern California, Swedish MS studies, and the UK Biobank were included. We estimated the association between each VDR-BV GIV and MS. Significant interaction between a VDR-BV GIV and a GIV for serum 25OH(D) was evidence for a causal association between VDR-BVs and MS unbiased by pleiotropy. We observed evidence for associations between two VDR-BVs (rs2881514, rs2531804) and MS after correction for multiple tests. There was evidence of interaction between rs2881514 and a 25(OH)D GIV, providing evidence of a causal association between rs2881514 and MS. This study is the first to demonstrate evidence that variation in VDR binding at a locus contributes to MS risk. Our results are relevant to other autoimmune diseases in which vitamin D plays a role.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».