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Enregistrement W4391777260 · doi:10.1111/cyt.13367

Molecular analysis of endobronchial ultrasound needle aspirates in patients with non‐small cell lung cancer: Results from the SCOPE database

2024· article· en· W4391777260 sur OpenAlexafffundabout
Erik Vakil, Elaine Dumoulin, Daniel Stollery, Ashley‐Mae Gillson, Paul MacEachern, Inderdeep Dhaliwal, Michael Mitchell, Li Pen, Colin Schieman, Nicholas P. J. Romatowski, Alex Chee, Chung Chun Tyan, Marc Fortin, Christopher A. Hergott, Alain Tremblay

Notice bibliographique

RevueCytopathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensAlberta Health ServicesWestern UniversityAlberta HealthUniversité LavalUniversity of SaskatchewanUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesUniversity of Calgary
Mots-clésMedicineLung cancerSubtypingRadiologyEndobronchial ultrasoundLungCarcinomaBronchoscopyFine-needle aspirationPathologyBiopsyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Molecular subtyping of non-small cell lung cancer (NSCLC) is critical in the diagnostic evaluation of patients with advanced disease. This study aimed to examine whether samples from endobronchial ultrasound transbronchial needle aspiration (EBUS-TBNA) of intrathoracic lymph nodes and/or lung lesions are adequate for molecular analysis across various institutions. METHODS: We retrospectively reviewed all cases of linear EBUS-TBNA with a final bronchoscopic diagnosis of NSCLC entered in the Stather Canadian Outcomes registry for chest ProcEdures database. The primary outcome was specimen inadequacy rate for each molecular target, as defined by the local laboratory or pathologist. RESULTS: A total of 866 EBUS-TBNA procedures for NSCLC were identified. Specimen inadequacy rates were 3.8% for EGFR, 2.5% for ALK-1 and 3.5% for PD-L1. Largest target size was not different between adequate and inadequate specimens, and rapid onsite evaluation did not increase specimen adequacy rates. One centre using next-generation sequencing for EGFR had lower adequacy rates than 2 others using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrophotometry. CONCLUSION: EBUS-TBNA specimens have a very low-specimen inadequacy rate for molecular subtyping of non-small cell lung cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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