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Enregistrement W4391793851 · doi:10.53555/sfs.v10i1s.2163

Protein – protein Interaction Mapping of Neurodegenerative Disease

2023· article· en· W4391793851 sur OpenAlexvenueno aff
A. Samanta, Semanti Ghosh

Notice bibliographique

RevueJournal of Survey in Fisheries Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein–protein interactionDiseaseNeuroscienceComputational biologyMedicineBiologyGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significant health risks are associated with neurodegenerative disorders. A variety of age-related factors have developed recently with the increase in the older population. These illnesses are characterised by the accumulation of proteins with altered physicochemical properties and the progressive degradation of neurons in the peritoneal and brain tissues. Some of the most challenging issues that modern nations face as their populations get older are Alzheimer's, Parkinson's, Huntington's, and amyotrophic lateral sclerosis. The four types of proteins that are involved in these illnesses are Huntingtin, Alpha-synuclein, Amyloid beta, and TAR DNA-binding protein of 43 kDa (TDP-43). Dopamine release and transport may be regulated by alpha-synuclein. Tau, a microtubule-associated protein, binds to STXBP1, a critical component of the synaptic vesicle exocytotic machinery, reducing caspase-3 activation potential function in synaptic vesicle exocytosis, which reduces neuronal sensitivity to various apoptotic events. The String database was used to identify protein-protein interactions between targets for neurodegenerative diseases that overlapped and were therefore considered to be potential targets. These disorders are linked to four different gene types: APBA2, TARDBP, HTT, and SNCA. Twenty possible neurodegenerative diseases were present in all.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,429
Score d'incertitude au seuil0,203

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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