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Enregistrement W4391817443 · doi:10.1016/j.xpro.2024.102885

Gaussian-process-based Bayesian optimization for neurostimulation interventions in rats

2024· article· en· W4391817443 sur OpenAlexafffund
Léo Choinière, Rose Guay-Hottin, Rémi Picard, Guillaume Lajoie, Marco Bonizzato, Numa Dancause

Notice bibliographique

RevueSTAR Protocols · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neural Engineering
Établissements canadiensUniversité de MontréalPolytechnique MontréalMila - Quebec Artificial Intelligence InstituteUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut de Valorisation des DonnéesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésNeurostimulationBayesian optimizationProtocol (science)Computer scienceGaussian processBayesian probabilityProcess (computing)GaussianNeuroscienceStimulationArtificial intelligencePsychologyMedicineChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effective neural stimulation requires adequate parametrization. Gaussian-process (GP)-based Bayesian optimization (BO) offers a framework to discover optimal stimulation parameters in real time. Here, we first provide a general protocol to deploy this framework in neurostimulation interventions and follow by exemplifying its use in detail. Specifically, we describe the steps to implant rats with multi-channel electrode arrays in the hindlimb motor cortex. We then detail how to utilize the GP-BO algorithm to maximize evoked target movements, measured as electromyographic responses. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Bonizzato and colleagues (2023).1

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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