<i>TSC22D</i> , <i>WNK</i> and <i>NRBP</i> gene families exhibit functional buffering and evolved with Metazoa for macromolecular crowd sensing
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY The ability to sense and respond to osmotic fluctuations is critical for the maintenance of cellular integrity. Myriad redundancies have evolved across all facets of osmosensing in metazoans, including among water and ion transporters, regulators of cellular morphology, and macromolecular crowding sensors, hampering efforts to gain a clear understanding of how cells respond to rapid water loss. In this study, we harness the power of gene co-essentiality analysis and genome-scale CRISPR-Cas9 screening to identify an unappreciated relationship between TSC22D2 , WNK1 and NRBP1 in regulating cell volume homeostasis. Each of these genes have paralogs and are functionally buffered for macromolecular crowd sensing and cell volume control. Within seconds of hyperosmotic stress, TSC22D, WNK and NRBP family members physically associate into cytoplasmic biocondensates, a process that is dependent on intrinsically disordered regions (IDRs). A close examination of these protein families across metazoans reveals that TSC22D genes evolved alongside a domain in NRBPs that specifically binds to TSC22D proteins, which we have termed NbrT ( N RBP b inding region with T SC22D), and this co-evolution is concomitant with rapid IDR length expansion in WNK family kinases. Our study identifies functions for unrecognized components of the cell volume sensing machinery and reveals that TSC22D , WNK and NRBP genes evolved as cytoplasmic crowding sensors in metazoans to co-regulate rapid cell volume changes in response to osmolarity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».