MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4391843538 · doi:10.1186/s12874-024-02161-1

Identifying biologically implausible values in big longitudinal data: an example applied to child growth data from the Brazilian food and nutrition surveillance system

2024· article· en· W4391843538 sur OpenAlexafffund
Juliana Freitas de Mello e Silva, Natanael de Jesus Silva, Thaís Rangel Bousquet Carrilho, Elizabete de Jesus Pinto, Aline S. Rocha, Jéssica Pedroso, Sara Araújo da Silva, Ana Maria Spaniol, Rafaella da Costa Santin de Andrade, Gisele Ane Bortolini, Enny S. Paixão, Gilberto Kac, Rita de Cássia Ribeiro‐Silva, Maurício L. Barreto

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueObesity, Physical Activity, Diet
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónSecretaría de Ciencia y Técnica, Universidad de Buenos AiresMinistério da SaúdeConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoGeneralitat de CatalunyaMichael Smith Health Research BCCentres de Recerca de CatalunyaMinisterio de Ciencia e InnovaciónWellcome TrustBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésOutlierAnthropometryLongitudinal studyPopulationLongitudinal dataStatisticsMedicineDemographyStandard scoreMathematicsEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Several strategies for identifying biologically implausible values in longitudinal anthropometric data have recently been proposed, but the suitability of these strategies for large population datasets needs to be better understood. This study evaluated the impact of removing population outliers and the additional value of identifying and removing longitudinal outliers on the trajectories of length/height and weight and on the prevalence of child growth indicators in a large longitudinal dataset of child growth data. METHODS: Length/height and weight measurements of children aged 0 to 59 months from the Brazilian Food and Nutrition Surveillance System were analyzed. Population outliers were identified using z-scores from the World Health Organization (WHO) growth charts. After identifying and removing population outliers, residuals from linear mixed-effects models were used to flag longitudinal outliers. The following cutoffs for residuals were tested to flag those: -3/+3, -4/+4, -5/+5, -6/+6. The selected child growth indicators included length/height-for-age z-scores and weight-for-age z-scores, classified according to the WHO charts. RESULTS: The dataset included 50,154,738 records from 10,775,496 children. Boys and girls had 5.74% and 5.31% of length/height and 5.19% and 4.74% of weight values flagged as population outliers, respectively. After removing those, the percentage of longitudinal outliers varied from 0.02% (<-6/>+6) to 1.47% (<-3/>+3) for length/height and from 0.07 to 1.44% for weight in boys. In girls, the percentage of longitudinal outliers varied from 0.01 to 1.50% for length/height and from 0.08 to 1.45% for weight. The initial removal of population outliers played the most substantial role in the growth trajectories as it was the first step in the cleaning process, while the additional removal of longitudinal outliers had lower influence on those, regardless of the cutoff adopted. The prevalence of the selected indicators were also affected by both population and longitudinal (to a lesser extent) outliers. CONCLUSIONS: Although both population and longitudinal outliers can detect biologically implausible values in child growth data, removing population outliers seemed more relevant in this large administrative dataset, especially in calculating summary statistics. However, both types of outliers need to be identified and removed for the proper evaluation of trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,034
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,316
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0340,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,642
Tête enseignante GPT0,520
Écart entre enseignants0,123 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Medical Research MethodologyMême sujetObesity, Physical Activity, DietTravaux en français237 207