A193 DECIPHERING THE INFLUENCE OF CROHN’S DISEASE-ASSOCIATED GENETIC RISK FACTOR, <i>NOD2</i> IN INTESTINAL FIBRO-STENOSIS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Intestinal fibrosis (IF) is a common debilitating complication associated with Crohn’s disease (CD), an idiopathic inflammatory bowel disease (IBD). IF results in severe strictures that affect the entire gastrointestinal tract, often requiring surgery due to limited or no effective treatment. In general, IF is a consequence of chronic inflammation, excessive extracellular matrix (ECM) deposition, aberrant cellular functions and tissue remodeling involving the innate and adaptive immune system. At the cellular level, fibrosis has been proposed to involve the crosstalk between epithelial cells, mesenchymal stromal cells and immune cells. However, the cascade of events that establish IF is poorly understood as it comprises a dynamic interplay between host genetics, immunity, gut microbiome and aberrant environment insults. Notably, polymorphisms in nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2 (NOD2; a bonafide cytosolic innate immune receptor), strong genetic risk factors for CD, also increase the incidence of IF. In this context, how NOD2 polymorphisms govern intestinal fibrostenosis in CD remains to be investigated. Aims To investigate how CD-associated risk gene, NOD2 contributes to intestinal fibrostenotic disease Methods We employed a single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) approach to explore the cellular landscape in our CD-mouse model, where we challenged Nod2-deficient mice with a chronic inflammatory insult regime, using dextran sulfate sodium (cDSS) for 3 cycles. Subsequently, changes in inflammatory, metabolic and fibrotic markers in the gut were analyzed by quantitative real-time PCR (qRT-PCR), immunohistochemistry (IHC) or western blot analyses. Further, RNA-In-situ hybridization (RNA-ISH) and flow cytometric analyses were performed to validate cell populations contributing to, and the molecular signatures linked with intestinal fibrostenosis. Results We found that Nod2-deficient mice show increased expression of pro-inflammatory cytokines (TNF, IL6) and excessive ECM deposition (fibrosis) in the gut compared to wild-type littermate mice post-cDSS. Curiously, scRNA-seq analysis uncovered altered stromal-immune-cell crosstalk along with the identification of a novel subset of the Dpt+ interstitial stromal population with distinct gene signatures regulated by chronic inflammation. Further, we observed increased senescence (Cdkn2a) mediated trans-differentiation of stroma into fibroblast contributing to IF in Nod2-deficient mice. Conclusions The study outlined will deepen our understanding of cellular and molecular mediators as well as inter and intra-cellular networks that drive IF. This will be transformative in devising therapeutic strategies to prevent IF in progressive CD patients. Funding Agencies CCC, CIHRThe American Association of Immunologist (AAI)
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».