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Enregistrement W4391873482 · doi:10.1093/jcag/gwad061.029

A29 INVESTIGATING THE IMPACT OF PARKINSON’S DISEASE-ASSOCIATED GENES ON INTESTINAL HOMEOSTASIS

2024· article· en· W4391873482 sur OpenAlexaff
Jessica Pei, Sherilyn Junelle Recinto, Adam MacDonald, Alexandra Kazanova, C Gavino, Louis‐Éric Trudeau, Michel Desjardins, J. Stratton, Samantha Gruenheid

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseHomeostasisParkinson's diseaseGeneNeuroscienceBiologyMedicineBioinformaticsGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Intestinal epithelial cells (IECs) provide an essential physical barrier between harsh luminal contents and underlying host tissue. The maintenance of intestinal homeostasis must be intricately regulated through the proliferation and differentiation of intestinal stem cells (ISCs). Dysregulation of this system results in the loss of barrier function, causing pathologies in both intestinal and extra-intestinal diseases. While Parkinson’s Disease (PD) is primarily a neurodegenerative disorder, there is increasing evidence linking PD progression and gastrointestinal (GI) dysfunction. Constipation and increased bowel permeability are often observed years prior to development of motor dysfunction in PD, and people with inflammatory bowel disease are more likely to develop PD. Our group developed a model to investigate the role of the gut in PD, demonstrating that mice with genetic ablation of the PD-associated gene Pink1 exhibited motor phenotypes only when previously infected with Gram-negative Citrobacter rodentium intestinal bacteria. As Pink1 and other PD-associated genes are expressed in IECs, we hypothesize that PD-associated gene mutations directly affect the epithelium and impact early PD pathophysiology. Aims 1. Determine how Pink1 mutation affects the transcriptional profiles in IECs at steady state and in vivo C. rodentium infection. 2. Use colonoid systems to study the effect of Pink1 mutation on epithelial activity. Methods ScRNAseq was performed on IECs isolated from uninfected and infected Pink1 WT and KO mice, sacrificed at day 7 and 14 (early and peak infection) to elucidate transcriptional differences between epithelial lineages of each genotype. Additionally, colonoids were derived from primary mouse tissue and treated with lipopolysaccharide (LPS) to determine how Pink1 KO affects the inflammatory response of the epithelium. Results Our data revealed that Pink1 KO profoundly affected several epithelial lineages. ISCs from infected Pink1 KO mice had dysregulated cell cycle genes, transit amplifying cells showed dysregulated expression of tight junction genes, and enterocytes displayed dysregulation in oxidative damage and apoptotic genes. Preliminary data from colonoids showed that Pink1 KO mice, when stimulated with LPS, had altered pro-inflammatory cytokine gene expression. We are also evaluating colon motility differences between genotypes through transit time assays, counting fecal pellets per hour, and fecal water content. Conclusions In Pink1 KO IECs, there is indeed an altered cellular response upon infection, but more information is needed to decern the mechanistic role of IECs in PD. By investigating the role of PD genes in the GI tract, these studies carry important implications for understanding the initiation and progression of PD. Funding Agencies CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,843

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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