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Enregistrement W4391873622 · doi:10.1093/jcag/gwad061.301

A301 RELATIONSHIP BETWEEN INTRAHEPATIC IMMUNE CELL PROFILE AND MICROBIOME ACCORDING TO DISEASE SEVERITY IN OBESE PATIENTS WITH NON-ALCOHOLIC FATTY LIVER DISEASE

2024· article· en· W4391873622 sur OpenAlexaff
Katherine J. P. Schwenger, Y Ghorbani, L Chen, Sandra E. Fischer, Timothy Jackson

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFatty liverDiseaseGastroenterologyAlcoholic liver diseaseMedicineImmune systemInternal medicineMicrobiomeImmunologyCirrhosisBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) includes histology ranging from simple steatosis (SS) to non-alcoholic steatohepatitis (NASH), fibrosis and cirrhosis. The pathogenesis of NAFLD is multifactorial and includes several immune cell-mediated inflammatory processes. Recent research suggests a potential relationship between NAFLD, disease severity and the intestinal microbiome (IM). In particular, our previous work in NAFLD showed that lower abundance of fecal Faecalibacterium prausnitzii was associated with liver histology and gene expression. In addition, we found that Kupffer cell markers, hematopoietic cell marker cluster of differentiation and B cells were associated with liver histology. Aims Knowing that F prausnitzii may have anti-inflammatory effect, we seek to determine if there was any association between fecal F prausnitzii and hepatic immune cells. Methods Biochemical and anthropometric measurements as well fecal samples for IM analysis were collected in those with obesity undergoing bariatric surgery. Fecal shotgun metagenome sequencing to profile the intestinal microbiome Liver histology was assessed using Brunt scoring system. The frequency, location and phenotype of 8 immune cell subtypes were analyzed by multiplex immunofluorescence. Spearman correlation coefficients and partial Spearman correlation coefficients were used to evaluate the association between significant hepatic immune cells and fecal F. prausnitzii. Results 113 patients had both hepatic immune and IM data. Of the 113 patients, 30 had normal liver obese (NLO), 41 had SS and 42 had NASH. With regards to hepatic immune cells, those with NAFLD (SS and NASH) or NASH had significantly higher Helper T, CD4 and B cells and lower activated macrophages compared to NLO. In those with NAFLD or NASH, F. prausnitzii was significantly negatively correlated with Helper T cells (NAFLD, R= -0.25, p-value 0.009; NASH, R= -0.25, p-value 0.038). In those with NASH, F. prausnitzii was also significantly negatively correlated with CD4 cells (R= -0.31, p-value 0.009). Conclusions Specific hepatic immune cells were associated with NAFLD and NASH with Helper T and CD4 cells being negatively correlated with F. prausnitzii. Knowing that these immune cells contribute to NAFLD pathogenesis, the relationship between fecal IM, hepatic immune cells and NAFLD require further exploration. Funding Agencies CIHRCanadian Liver Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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