A38 EXPLORING HOW BOWEL PREPARATION CAN AFFECT INFLAMMATORY BOWEL DISEASE VIA THE GUT MICROBIOTA
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Inflammatory bowel disease (IBD) is a debilitating disorder that targets the gastrointestinal (GI) tract. Although its causes remain unknown, recent studies have identified changes to the gut microbiota associated with IBD. While most gut bacteria are essential for GI health, pathobionts are bacteria that are prevalent in IBD patients and that can act as pathogens and induce inflammation. IBD patients undergo routine endoscopies which require the administration of laxative-based bowel prep to clear out the luminal contents of the GI for the endoscope. It has been found that after bowel prep some IBD patients experience inflammatory flareups. IBD patients may experience adverse reactions following bowel prep, including increased inflammation, emergency room visits, and medication adjustments. Importantly, bowel prep perturbs the gut microbiota, depleting beneficial microorganisms, while allowing pathobiont strains to thrive, which could be the cause for worsened symptoms post-bowel prep in some patients. Aims We hypothesize that the altered intestinal microenvironment during bowel prep causes commensal bacteria depletion and favours osmotolerant pathogenic species that lead to increased inflammation in two systems: 1) in a model disease-causing microorganism, Salmonella enterica 2) in an IBD microbiota. Methods To investigate pathogen expansion after bowel prep a Salmonella mouse model was established. Microbiota changes were determined by 16S rRNA sequencing and spot plating. Changes to the gut environment and the mechanism for pathogen colonization were characterized using Salmonella mutants and confocal imaging. To identify changes to the IBD microbiota, a humanized mouse model was established, and microbiota changes were investigated as done in the Salmonella model. IBD-associated pathobiont growth was also characterized in in vitro conditions that were identified in our in vivo model. Results We have demonstrated that bowel prep increases GI osmolality and leads to increased Salmonella colonization in the gut and systemic organs following bowel prep unlike mice treated with vehicle, supporting our hypothesis. We then explored the effects of bowel prep in a humanized mouse model of IBD, which showed increased translocation of bacteria from the gut to internal organs post-prep. Additionally, IBD-associated pathobionts were able to grow much greater than commensal strains highlighting that IBD pathobionts can persist in the gut after bowel prep. Conclusions Our study highlights that bowel prep disrupts the gut microbiota and the intestinal environment allowing for pathogen colonization and bacterial translocation. Therefore, bacterial translocation could provide mechanistic insight for inflammatory flareups following bowel prep. Ultimately, our research underscores the importance of the gut environment in facilitating pathobiont exacerbation of IBD. Funding Agencies CIHR
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».