A39 DEVELOPMENTALLY REGULATED CECAL CONTENT MICRO-RNAS CORRELATE WITH MATURING MICROBIOTA GENES AND FUNCTIONS IN JUVENILE MICE
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The gut microbiome establishment in early life is critical to life-long health and influenced by the maternal gut ecosystem. MicroRNAs (miRNAs) have emerged as a new player in host-microbiota interaction due to their regulatory effect on bacterial genes. We previously found that maternal supplementation with a probiotic mix of Lacticaseibacillus rhamnosus R0011 and Lactobacillus helveticus R0052 supported the maturation of microbial metabolic activity and altered the cecal content miRNA profile in juvenile mice. Aims To investigate the relationship between cecal content miRNAs and inferred microbiota genes and functions in early life and identify potential miRNA-bacterial gene targets. Methods We generated 16S rRNA gene sequencing and NanoString nCounter® data from the cecal content of 14, 21, and 36-days-old C57BL/6 mice born to dams receiving or not probiotic-supplemented water since preconception. Taxa contributions to bacterial enzyme-encoding genes and pathways were inferred with PICRUSt2. Time or group-altered genes, pathways, and miRNAs were identified with DESeq2. Spearman correlations were performed between miRNAs and bacterial genes or pathways (n= 3-5 male offspring/PND/group) and significant correlations (q ampersand:003C 0.05) were visualized with NAViGaTOR. Potential miRNA binding sites on bacterial genes were investigated using the ViennaRNA Package. Results Time-associated miR-433 positively correlated with two time-altered genes involved in the TCA and glyoxylate cycles. Group-associated miR-691 was positively correlated with genes related to tRNA charging pathway, pyruvate fermentation to acetate and lactate, and amino acids biosynthesis. Additionally, miR-691 was negatively correlated with six group-altered genes involved in myo-inositol degradation. We identified potential miRNA binding sites (total free energy of binding ampersand:003C -10 kcal/mol) for miR-691 with genes involved in pyruvate fermentation, lysine biosynthesis, and myo-inositol degradation, and for miR-433 with genes annotated to the TCA and glyoxylate cycles. Conclusions Host miRNAs correlate with bacterial pathways and genes maturing during the weaning transition, highlighting their potential to regulate microbial metabolic activity. Maternal probiotics supplementation may accelerate the development of microbial metabolic pathways through epigenetic mechanisms, independently of weaning dietary shift. Correlations identified include energy production pathways and may become clinical targets in infants with delayed maturation of the intestinal ecosystem. Funding Agencies NSERC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».