A1 PRE-CLINICAL CROHN’S DISEASE MICROBIOME PROMOTES INFLAMMATION IN GNOTOBIOTIC RECIPIENT MICE
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Crohn’s disease (CD) is a chronic disorder of unknow etiology. We recently demonstrated that microbiome composition is associated with the risk of CD development; however, its potential causal effect remains unknown. Aims Given the fact that first-degree relatives (FDRs) that are sibling likely to share similar environmental and genetic makeup, we selected pairs of discordant siblings (one remaining healthy referred to as healthy matched control-HMC, and the other who developed CD later on referred to as pre-CD) to investigate whether the microbiome contributes to or triggers dysregulated immune response by transplanting microbiome from them into germ-free mice (GFM). Methods Faecal samples from discordant siblings, recruited as part of the CCC-GEM project, a cohort of prospectively followed healthy first-degree relatives, were transplanted into RAG1-/- GFM before T-cell transfer-induced colitis. Fecal Lipocalin-2 (LCN-2) was measured by ELISA to assess gut inflammation. Body weight was monitored for 6 weeks after T-cell transfer. Intestinal tissue damage was assessed by histology scoring (PMID: 8623920). Pro-inflammatory cytokine gene profile of ileum and colon tissue was measured by qPCR. R-software was used for statistical analysis. Results Our results showed that mouse recipients of pre-CD microbiota experienced more weight loss than HMC group, with a greater difference observed in the second week after inducing colitis (p=0.0019). LCN-2 of pre-CD mice was significantly higher after T-cell transfer for 3 weeks. Intriguingly, pre-CD stool recipient mice had higher histological damage score in the ileum (p=0.025). Histological analysis revealed that granulomatous inflammation, mucin depletion, crypt loss were greater in pre-CD group (p≤0.05). Pre-CD stool promoted the expression of selected pro-inflammatory cytokine genes in the ileum with significant increases of TNFα, IL-1β, IFNγ, IL10 and TGFβ compared to mice that received HMC microbiome. Colonic tissue showed significant increases in TNFα and TGFβ in the mice recipient of the pre-CD microbiome. Conclusions These results suggests that pre-CD microbiome can worsen T cell transfer colitis in mice compared to HMC microbiome. This suggests that microbiome or other constituents of stool from pre-CD subjects are major contributors to the onset of disease. Modulating pre-CD microbiome composition could lead to novel methods to prevent CD onset. Funding Agencies CCC, CIHRWeston Family Foundation, Helmsley, Biocodex
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».