MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4391886358 · doi:10.1093/jcag/gwad061.195

A195 IL-13 DRIVES CROHN’S DISEASE ASSOCIATED-INTESTINAL FIBROSIS IN SHIP DEFICIENT MICE

2024· article· en· W4391886358 sur OpenAlexaff
Kwestan Safari, Susan C. Menzies, Laura M. Sly

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEosinophilic Esophagitis
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrohn's diseaseDiseaseFibrosisMedicineGastroenterologyInternal medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Crohn’s disease (CD) is an immune-mediated disease characterized by chronic, relapsing and remitting, or progressive inflammation of the digestive tract. One in 3 people with CD will develop intestinal fibrosis requiring surgery within 10 years of diagnosis. Biological therapy is effective at reducing inflammation in CD and early and aggressive treatment with biologics will reduce the incidence of fibrosis. However, in children, for whom a step-up approach to therapy is used, and populations that are refractory to biological therapy; fibrosis remains a serious concern. Treatments are urgently needed as currently there are no treatments that target intestinal fibrosis directly in CD. Mice deficient in the Src homology 2 domain-containing inositolpolyphosphate 5’-phosphatase (SHIP-/-) develop spontaneous CD-like ileal inflammation and fibrosis. Fibrosis is dependent on PI3Kp110δ activity. IL-4 and IL-13 lead to downstream activation of PI3Kp110δ. Recent work in our lab has shown through pharmacological inhibition that the development of fibrosis in SHIP-/- mice is dependenet on IL-13 signaling, but not IL-4. Aims Aim 1: To determine whether genetic ablation of IL-13 prevents ileal fibrosis in SHIP-/- mice Aim 2: To determine the cellular source of IL-13 in the distal ileum of SHIP-/- mice Aim 3: To determine the cellular source of IL-13 in the distal ileum of individuals with CD Methods SHIP-/- mice were crossed with IL-13 deficient mice (IL13-/-) to generate SHIP+/+IL13+/+, SHIP+/+IL13-/-, SHIP-/-IL13+/+, and SHIP-/-IL13-/- mice. Measurements of ileal fibrosis included gross and histopathology, muscle thickening, and collagen accumulation (Masson’s trichrome staining for fibrosis). Single cell RNA sequencing (snRNA-seq) was performed on the distal ileum of SHIP-/- mice to determine the cellular source of IL-13. Previously published scRNA-seq data were analyzed to determine the cellular source of IL-13 in individuals with CD. Results Genetic ablation of IL-13 in SHIP-/- mice (SHIP-/-IL13-/-) reduced the development of ileal fibrosis. Analysis of single cell RNA sequencing data (scRNA seq) has revealed mast cells as the cellular source of IL-13 in the distal ileum of people with CD. Conclusions Mast cell derived IL-13 may be driving the development of intestinal fibrosis in CD. Our data suggest that an antibody-based biologic targeting IL-13 may be an effective strategy to prevent fibrosis in people with Crohn’s Disease. Funding Agencies CAG, CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of GastroenterologyMême sujetEosinophilic EsophagitisTravaux en français237 207