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Enregistrement W4391886403 · doi:10.1093/jcag/gwad061.275

A275 THE POTENTIAL MECHANISTIC ROLES OF SPHINGOLIPIDS IN HEALTHY FIRST-DEGREE RELATIVES OF PATIENTS WITH CROHN'S DISEASE

2024· article· en· W4391886403 sur OpenAlexafffundabout
Meilan Xue, S Lee, Anna Neustaeter, J Shao, Hien Q. Huynh, A M Griffiths, Dan Turner, Karen Madsen, Paul Moayyedi, H Steinhart, Alain Bitton, D Mack, Kevan Jacobson, Mark J. Ropeleski, Maria Cino, Çharles N. Bernstein, Remo Panaccione, Brian Bressler, Williams Turpin, Kenneth Croitoru

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of ManitobaQueen's UniversityPopulation Health Research InstituteChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University Health CentreUniversity of OttawaUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenSinai Health SystemUniversity of AlbertaUniversity of CalgaryLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoHebrew University of JerusalemQueen's UniversityMax Rady College of Medicine, University of ManitobaUniversity of AlbertaMcGill University Health CentreMount Sinai Health SystemMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Mots-clésCrohn's diseaseSphingolipidDegree (music)DiseaseFirst-degree relativesMedicineImmunologyBiologyGeneticsInternal medicinePhysicsFamily history

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Crohn's Disease(CD) features a complex etiology intertwining genetic, environmental, and immunological dimensions. Sphingolipids (SPs) are pivotal lipid molecules within cell membranes and various biological processes, including cell growth, apoptosis, and inflammatory responses. While our prior research identified SPs as significant risk factors for CD onset, their pre-clinical influence on CD risk biomarkers and potential role in pathogenesis remains unclear Aims To identify the relationship between SPs and established CD risk factors Methods We used samples from healthy first-degree relatives(FDRs), followed in a nested case-control cohort from the Crohn's Colitis Canada- Genes, Environment, Microbial(GEM) project, matching those who developed CD(n=77) with control FDRs(n=303) based on age, sex, follow-up time, and geographic location. 59 SPs were selected from serum metabolites measured via an untargeted metabolomics platform. We used partial Spearman correlation to identify relationships between SPs and CD risk factors: i)intestinal permeability via the urinary fractional excretion ratio of lactulose to mannitol(LMR); ii)gut subclinical inflammation using fecal calprotectin(FCP); iii)systemic inflammation with C-reactive protein(CRP); iv)microbiome composition through fecal 16S rRNA sequencing and v)serum protein profile using the Olink® Proximity Extension Assay platform. A two-sided qampersand:003C0.05 was considered significant Results We identified 38 positive correlations between CRP and SPs across various sub-pathways, including Ceramides, Sphingomyelins and Hexosylceramides(0.117≤rho≤0.342, 1.37×10−09≤q≤0.042). One SP Ceramide(d18:1/16:0) correlated positively with FCP(rho=0.201, q=0.012). Moreover, two SPs, N-palmitoyl-sphingosine (d18:1/16:0) and glycosyl-N-(2-hydroxynervonoyl)-sphingosine (d18:1/24:1(2OH)), correlationed with Peptoclostridium genus (rho=0.465 and -0.245, q=1.47×10−16 and 0.028 respectively). All SPs correlated with one or more proteins, most positively between Sphingosine-1-phosphate and non-receptor tyrosine kinase(rho=0.637, q=1.98 ×10−36) and most negatively between sphingadienine and Chymotrypsin-C protein(rho=-0.334, q=4.11×10−8). No significant correlations emerged between SPs and LMR Conclusions We identified correlations between SPs and CD risk factors. The correlation with CRP suggests SPs might contribute to systemic inflammatory pathways related to CD. Moreover, correlations with the bacterial taxa highlight SPs' potential role in regulating microbial composition. Extensive correlations with proteins emphasize the pivotal impact of SPs on their function. This study may offer new insights into CD prevention Funding Agencies CCC, CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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