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Enregistrement W4391886483 · doi:10.1093/jcag/gwad061.040

A40 THE ROLE OF HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR IN CELLULAR METABOLIC ADAPTATION UPON <i>GIARDIA</i> INFECTION

2024· article· en· W4391886483 sur OpenAlexafffundabout
Emily DeMichele, Olivia Sosnowski, Thibault Allain, André G. Buret

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHypoxia (environmental)Adaptation (eye)GiardiaHypoxia-inducible factorsMicrobiologyBiologyImmunologyChemistryBiochemistryGeneNeuroscienceOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Recent findings have highlighted the integral role of oxygen tension in gastrointestinal (GI) homeostasis. During hypoxia when oxygen supply is limited, mammalian cells utilize the Hypoxia-Inducible Factor (HIF) complex to activate genes that promote cell survival and alter glucose metabolism. The GI system exists in a state of physiologic hypoxia, subject to further alterations by pathogens. Although tissue and blood parasites are known to influence tissue oxygen tension, little is known regarding the modulation of hypoxia and HIF by enteric parasites. Aims This project aims to characterize the effect of Giardia duodenalis, a common enteric protozoan that perturbs gastrointestinal function leading to diarrheal disease, on the cellular hypoxic response. We hypothesize that hypoxia-associated genes are activated upon Giardia infection, leading to an adaptive metabolic response with increased glycolytic flux to maintain cellular bioenergetic homeostasis. Methods Caco-2 colonic epithelial cells were infected with Giardia isolate GS/M (MOI 10) for 1.5 or 4.5 hours to capture early and peak HIF activation, under normoxic (21% O2) or hypoxic (1%O2, STEMCELL hypoxia incubator) conditions. RNA was extracted for RT-qPCR to assess transcriptional changes of known HIF-target genes. Intracellular metabolite analysis via liquid-chromatography mass-spectrometry (hydrophilic-interaction chromatography method) was performed to assess HIF-mediated metabolic changes in uninfected and Giardia-infected cells (MOI 10) exposed to the hypoxia mimetic DMOG or the HIF inhibitor PX-478. Results Under normoxic conditions, genes associated with compensatory cellular stress responses such as VEGFA, ANKRD37, GADD45A, and glycolysis-associated genes HK2, and LDHA are upregulated in Giardia-infected cells in a time-dependent manner (pampersand:003C0.05). Under hypoxic conditions, fewer HIF-target genes are upregulated (e.g., VEGFA, GADD45A, PGK1; pampersand:003C0.05), suggesting Giardia-infected cells behave similarly to uninfected cells with constant HIF activation. Analysis of the Caco-2 intracellular metabolome indicates HIF-dependent changes in amino acid (e.g., glycine, threonine) and nucleic acid (e.g., guanosine, inosine, uracil) metabolism. DMOG treatment altered the production of glycolytic intermediates (e.g., DHAP, PEP), confirming the promotion of glycolytic flux by HIF. Conclusions Both cell-stress-related and glucose-metabolism HIF target genes are activated upon Giardia infection. As well, some metabolic changes are dependent on HIF activation. These novel findings indicate Giardia promotes a hypoxic state in human intestinal cells, highlighting a metabolic cell rescue mechanism in response to enteropathogens. Furthermore, understanding the role of hypoxia in enteric parasitic infections will shed light on the potential of HIF as a therapeutic target. Funding Agencies Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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