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Enregistrement W4391886557 · doi:10.1016/j.jlr.2024.100518

Elovl4b knockout zebrafish as a model for ocular very-long-chain PUFA deficiency

2024· article· en· W4391886557 sur OpenAlexfundno aff
Uzoamaka Nwagbo, Saba Parvez, J. Alan Maschek, Paul S. Bernstein

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Eye InstituteUniversity of UtahResearch to Prevent BlindnessNational Institutes of HealthFoundation Fighting Blindness
Mots-clésZebrafishKnockout mouseBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Very-long-chain polyunsaturated fatty acids (VLC-PUFAs) are a group of lipids with chain lengths >24 carbons, and the ELOVL4 enzyme is responsible for the rate-limiting step in vertebrate VLC-PUFA biosynthesis. Studies on the role of VLC-PUFAs in vision have been hindered due to the need for adequate animal models to capture the global loss of VLC-PUFAs. Since homozygous Elovl4 ablation is lethal in neonatal mice due to catastrophic drying from the loss of their protective skin barrier, we established a zebrafish model of Elovl4 ablation. We generated Elovl4b knockout zebrafish by creating a 56-bp deletion mutation in exon 2 of the Elovl4b gene using CRISPR-Cas9. We used GC-MS and LC-MS/MS to analyze the VLC-PUFA and lipid profiles from adult wild-type and Elovl4b knockout fish eyes. We also performed histology and visual-behavioral tests. We found that heterozygous and homozygous Elovl4b knockout zebrafish eyes had altered lipid profiles and a significantly lower C30 to C36 VLC-PUFA abundance than age-matched wild-type fish. Moreover, Elovl4b+/- and Elovl4b-/- knockout larvae had significantly lower motor activity in response to light-dark cycles in the visual-motor response test than their age-matched controls. Elovl4b-/- adult fish showed no obvious differences in gross retinal morphology and lamination compared to wild-type, except for the presence of lipid droplets within the retinal pigment epithelial cell layer of Elovl4b-/- fish. Our data indicate that the loss of Elovl4b in zebrafish can cause changes in lipid profiles, visual abnormalities, and subtle retinal changes. These findings highlight the use of zebrafish as a model for VLC-PUFA-depletion and ELOVL4-related dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,190
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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