Genetic Prediction of Smoking Cessation Medication Side Effects: A Genome‐Wide Investigation of Abnormal Dreams on Varenicline
Notice bibliographique
Résumé
Varenicline, the most efficacious smoking cessation monotherapy, produces abnormal dreams. Although genetic contributions to varenicline‐associated nausea and cessation have been identified, the role of genetics in abnormal dreams is unknown. We conducted a genomewide association study (GWAS) of abnormal dreams in 188 European ancestry smokers treated with varenicline (NCT01314001). Additive genetic models examined the likelihood of experiencing abnormal dreams 2 weeks following varenicline initiation. For the top locus, we tested for selectivity to varenicline, effects on cessation, replication, and generalizability to African ancestry (AA) individuals. The top GWAS variant associated with abnormal dreams was rs901886, mapping to intron 2 of ICAM5 on chromosome 19. The prevalence of abnormal dreams in those with rs901886 CC, CT, and TT genotypes was 15%, 36%, and 62%, respectively (odds ratio = 2.94 for T vs. C, 95% confidence interval = 1.92–4.55, P = 2.03e−7; T allele frequency = 52%). This rs901886 association was selective to varenicline (P values > 0.05 on nicotine patch and placebo). There were also positive associations for rs901886 T (vs. C allele, P = 0.03) and for abnormal dreams (P = 0.06) with varenicline‐aided cessation. Neither rs901886 (P = 0.40) nor abnormal dreams (P = 0.24) were associated with adherence. A similar direction of effect of rs901886 on abnormal dreams was observed in a second varenicline trial (NCT01836276). In AA individuals (n = 137), rs901886 was not associated with abnormal dreams (P = 0.41), but there was an association for a variant located ~ 74.4 kb 5′ of ICAM5 (P = 2.56e−3). Variation in ICAM5 may influence abnormal dreams and cessation on varenicline. These findings provide additional support for genetically optimized smoking cessation approaches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».