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Enregistrement W4391947555 · doi:10.1101/2024.02.17.580698

Large-scale visualisation of α-synuclein oligomers in Parkinson's disease brain tissue

2024· preprint· en· W4391947555 sur OpenAlexafffund
Rebecca Andrews, Bin Fu, Christina E. Toomey, Jonathan C. Breiter, Joanne Lachica, Ru Tian, Joseph S. Beckwith, Lisa-Maria Needham, Gregory J. Chant, Camille Loiseau, Angèle Deconfin, Kenza Baspin, Peter J. Magill, Zane Jaunmuktane, Oliver Freeman, Ben Taylor, John Hardy, Tammaryn Lashley, Mina Ryten, Michele Vendruscolo, Nicholas Wood, Lucien E. Weiss, Sonia Gandhi, Steven F. Lee

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundMedical Research CouncilPolytechnique MontréalMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésParkinson's diseaseNeuroscienceOligomerDementia with Lewy bodiesHuman brainAutofluorescenceThioflavinPathogenesisDiseaseNeuriteAmyloid (mycology)Brain tissueAnterior cingulate cortexChemistryPathologyBiologyMedicineFluorescenceDementiaAlzheimer's diseaseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parkinson's disease (PD) is a common neurodegenerative condition characterised by the presence in the brain of large intraneuronal aggregates, known as Lewy bodies and Lewy neurites, containing fibrillar α-synuclein. According to the amyloid hypothesis, these large end-stage species form from smaller soluble protein assemblies, often termed oligomers, which are proposed as early drivers of pathogenesis. To date, however, this hypothesis has remained controversial, at least in part because it has not been possible to directly visualise oligomeric aggregates in human brain tissue. Therefore, their presence, abundance and distributions have remained elusive. Here, we present ASA-PD (Advanced Sensing of Aggregates - Parkinson's Disease), an imaging method to generate large-scale α-synuclein oligomer maps in post-mortem human brain tissue. We combined autofluorescence suppression with single-molecule fluorescence methods, which together, enable the detection of nanoscale α-synuclein aggregates. To demonstrate the utility of this platform, we captured ~1.2 million oligomers from the anterior cingulate cortex in human post-mortem brain samples from PD and healthy control patients. Our data revealed a specific subpopulation of nanoscale oligomers that represent an early hallmark of the proteinopathy that underlies PD. We anticipate that quantitative information about oligomer distributions provided by ASA-PD will enable mechanistic studies to reveal the pathological processes caused by α-synuclein aggregation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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