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Enregistrement W4391955837 · doi:10.1021/acs.biochem.3c00647

Lipid-Dependent Activation of the Orphan G Protein-Coupled Receptor, GPR3

2024· article· en· W4391955837 sur OpenAlexaff
Isabella C. Russell, Xin Zhang, Fabian Bumbak, Samantha M. McNeill, Tracy M. Josephs, Michael G. Leeming, George Christopoulos, Hariprasad Venugopal, Maria M. Flocco, Patrick M. Sexton, Denise Wootten, Matthew J. Belousoff

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésG protein-coupled receptorOrphan receptorChemistryReceptorLigand (biochemistry)Drug discoveryPlasma protein bindingTransmembrane proteinTransmembrane domainCell biologyBiophysicsBiochemistryBiologyGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The class A orphan G protein-coupled receptor (GPCR), GPR3, has been implicated in a variety of conditions, including Alzheimer’s and premature ovarian failure. GPR3 constitutively couples with Gαs, resulting in the production of cAMP in cells. While tool compounds and several putative endogenous ligands have emerged for the receptor, its endogenous ligand, if it exists, remains a mystery. As novel potential drug targets, the structures of orphan GPCRs have been of increasing interest, revealing distinct modes of activation, including autoactivation, presence of constitutively activating mutations, or via cryptic ligands. Here, we present a cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure of the orphan GPCR, GPR3 in complex with DNGαs and Gβ 1 γ 2 . The structure revealed clear density for a lipid-like ligand that bound within an extended hydrophobic groove, suggesting that the observed “constitutive activity” was likely due to activation via a lipid that may be ubiquitously present. Analysis of conformational variance within the cryo-EM data set revealed twisting motions of the GPR3 transmembrane helices that appeared coordinated with changes in the lipid-like density. We propose a mechanism for the binding of a lipid to its putative orthosteric binding pocket linked to the GPR3 dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,440

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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